以乙酰乳酸合成酶(ALS，AHAS)为靶标合理设计开发新型超高效除草剂是除草剂化学研究中的重要领域。本论文就是结合本课题组的研究工作，将计算机辅助分子设计与传统的方法相接合，以加速新型除草剂的研发。　　 论文分3部分：　　 1.在本小组所发现的一类具有全新结构的2-嘧啶氧基-N-芳基苄胺类先导化合物的基础上，进行结构修饰和优化，以期发现除草活性更高、安全性更好和农作物选择性更广的新化合物结构。利用前人对除草剂的构效关系研究经验，在芳香环A分别引进能保持药剂亲油亲水性能的平衡基团如酰胺基、磺酰胺基等：母坏6位引入氯原子。总共合成了27个化合物。从已有生测数据来看，芳香坏A上分别引进酰胺基、磺酰胺基、母环6-位Cl取代，均有利于提高除草活性和改善农作物的选择性。　　 2.在本小组工作的基础上，对2-嘧啶氧基-N-芳基苄胺类化合物进行了QSAR研究，分别用几种不同的方法建立QSAR模型。通过r2，rcv2，标准偏差等统计学参数对这些模型的性能进行比较。所得到的模型均有良好的拟合能力和预测能力，并且这些模型之间可以相互验证。表明这些模型可以用来预测新的化合物的活性。　　 3.采用柔性分子对接技术，将16个磺酰胺类、62个嘧啶水杨酸类和3个咪唑啉酮类除草剂分子对接到AHAS酶切割复合物中，从原子水平和分子力场角度阐明了这三类抑制剂与AHAS的相互作用机制。研究发现，磺酰胺类、嘧啶水杨酸类分子插入AHAS复合物的切割位点，并与钱基LYS251，ARG380形成氢键作用，而咪唑啉酮类化合物的结合位点则有所不同。在此基础上，对嘧啶水杨酸类抑制剂进行QSAR研究，分别用CoMFA、CoMSIA、HQSAR、EVA方法建立QSAR模型。所得到的模型均有良好的拟合能力和预测能力，并且这些模型之间、以及和对接结果之间均可以相互验证。表明这些模型可以用来预测新配体的生物活性。