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玉米是一种重要的禾谷类作物。由于干旱对玉米生产带来巨大损失，抗旱遗传育种已成为玉米遗传改良的一个重要方向。种子萌发、出苗是玉米生长的开始阶段，在土壤水分胁迫下保持较高的出苗率和壮苗率，直接关系到以后的生长发育和产量形成。出于玉米在生长期的许多抗旱相关性状是受多基因控制的，且受环境影响，使得抗旱性QTL的定位和遗传分析成为抗旱育种的理论指导。SSR标记技术的发展为研究抗旱遗传规律，定位重要抗旱性状提供了新的技术手段。本研究利用Mo17×黄早四的F9重组自交系群体（共239系），构建分子图谱，并进行实验室模拟干旱胁迫环境下，芽苗期抗旱性状的QTL定位及遗传效应分析。主要结果如下： 1．从370对SSR引物中筛选出101对，应用mapmaker／EXP3.0b软件构建SSR分子标记连锁图谱。所构建的图谱覆盖玉米基因组1422.7cM，标记间平均图距为15.6cM，该连锁图谱与IBM群体所作图谱基本一致，能有效地进行QTL定位的研究。 2．运用复合区间作图法对玉米芽苗期抗旱QTL进行了定位和遗传效应分析。结果共检测到22个QTL分散在全部10条染色体。 3．在第1，5和10染色体上定位到种子萌发抗旱指数的三个主效QTL，与其连锁的SSR标记分别为umc1358，bnlg1006和phi050，相应的LOD值分别为3.76，4.79和2.17，加性效应分别为1.47％，-1.50％和-1.40％，其加性效应能解释表型方差分别为49.37％，50.53％和44.46％。 4．在正常供水条件下，在第4，8，9染色体上检测到3个苗期茎含水量QTL，与其连锁的SSR标记分别为phi021，dupssr14，bnlg1583，加性效应能解释表型方差为6.9％-14.40％，他们均来源于Mo17，其加性效应使含水量提高0.03％-0.04％。对于叶片含水量，检测到3个QTL，他们分别与邻近标记bnlg439，umc1867，nc134连锁，其加性效应能解释表型方差为7.03％-14.32％，来源于Mo17定位在第9染色体上QTL加性效应使含水量提高0.04％，另一个定位在第9染色体上的QTL和定位在第1染色体上的QTL增效基因均来源于黄早四。