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天然气水合物的主要成分是甲烷，它在环境和能源方面都有着重大意义，但是由于对天然气水合物的开发存在很大技术上的困难，所以，我国对天然气水合物的研究还不深刻，尽管我国是一个天然气水合物含量很大的国家，但是我国对此的研究直到2008年才取得了有目共睹的成果，获得了天然气水合物，这为我国寻找和开发新能源奠定了很好的基础。迄今，人们一直关注对天然气水合物成因的研究，除了物理化学、热力学等因素，近些年来人们又对微生物成因做出了合理的解释，并且认为这一因素是天然气水合物的主要成因。本课题的研究就是针对冻土区天然气水合物的微生物研究而展开的，目的是为了寻找出二者之间的关系以及开发出一种寻找天然气水合物的快速、有效的方法。本课题对微生物的研究主要有以下几方面：(1)祁连山冻土区天然气水合物中甲烷氧化菌的分离与鉴定，通过多种培养基、多种培养条件对甲烷氧化菌进行富集培养，结果在选取的15件样品中，并没有发现甲烷氧化菌。(2)祁连山冻土区天然气水合物中硫酸盐还原菌的分离与鉴定，通过多种培养基、多种培养条件对硫酸盐还原菌进行富集培养，结果在选取的15件样品中，并没有发现硫酸盐还原菌。(3)尽管没有发现甲烷氧化菌和硫酸盐还原菌，但是却分离出来8113种好氧菌，DK2样品分离出4478个菌落，鉴定出89株菌株，DK6样品分离出3635个菌落，鉴定出117株菌株。(4)祁连山冻土区天然气水合物中厌氧菌的分离与鉴定，在多种培养基、不同的培养条件下，对厌氧菌的分离有如下结果：共分离出的厌氧菌落有近1997个，DK2样品分离出1103个菌落，鉴定出57株菌株，DK6样品分离出894个菌落，鉴定出61株菌株。对这些菌株进行计数分析和多样性指数分析，确定DK6的多样性好于DK2。(5)祁连山冻土区天然气水合物中新种Hymenobacter sp.的分离与鉴定，在分离微生物时，发现了一株新种，对新种进行形态观察、生理生化分析、呼吸醌、脂肪酸、G+C(mol%)、DNA-DNA杂交的分析，确定该菌是Hymenobacter sp.的一株新种。