在社会主义市场经济体制不够完善的条件下,医药行业市场经济秩序混乱,造成以商业贿赂为代表的各种不正当竞争行为持续蔓延。商业贿赂直接影响了医疗服务水平与卫生事业发展,事关老百姓的切身利益,日益成为全民热议的焦点话题。要从根本上治理医药行业商业贿赂,就要对现行的治理措施进行反思,找出问题,通过借鉴一些国际治理经验,提出适合中国的医药行业商业贿赂治理方式。医药行业商业贿赂的治理进程可以分为事前、事中、事后三个阶段,每个阶段存在着不同的问题。事前阶段医疗服务体制不合理,医药市场机制不畅,相关法律法规缺失；事中阶段政府的指导工作不到位,工商行政执法部门职能缺位；事后阶段司法部门重视程度不足,处罚力度过轻,标准不一。其原因主要包括,政府财政投入不足、现行法律法规效力不理想、市场准入把关不严、药品集中招标采购不规范、收入分配制度不合理、公众重视程度不足六个方面。通过构建治理长效机制来防治医药行业商业贿赂行为,具体分为制度、法律、教育并重的预防机制,医药产业发展的调控机制,医药行业监督制约机制,以及以政府为主导的多元化治理体系。