近年来我国经济发展速度逐渐加快，经济总量也不断的增长，在国际上越来越显现出重要的地位。为了适应经济全球化的主流趋势，找到更加适合我国经济发展的道路，在全国范围内普及ERP系统的应用对我国的发展现状来说，既是机遇，也是挑战。此次研究的目的主要在于为我国的制药行业发展方向与思路提供借鉴，并为尝试启用ERP系统的企业提供帮助，为我国整体ERP系统应用水平的提高和经济的进步做出一定的贡献。通过ERP系统完善企业内部控制，不仅能优化业务流程并规范企业管理，有效遏制虚假会计信息的产生，且能为管理者提供更有效决策以实现企业最佳效益。
　　目前，在政府政策的支持下，制药行业凭借先进的资源设备与技术，在市场需求的拉动下，发展前景甚是广阔。而实施ERP系统有助于制药企业的管理由传统粗放型向现代精细化管理的转变，这对制药企业管理来说是一次全面的变革。在制药行业通过ERP系统加强企业的内部控制，不仅可以优化业务流程并规范企业管理，有效遏制虚假会计信息的产生，甚至还能为管理者提供更加有效的决策，实现企业最佳效益。从我国实施ERP的意义、内容及目前发展状况入手，以D制药企业为例，运用文献研究法、理论分析法及案例分析法等，通过对其在ERP环境下销售环节内部控制相关问题深入分析，如内部控制环境、内部控制的风险评估、控制中的信息与沟通、控制的活动以及监控等，找出其实施ERP系统过程中的难点及对策，进而对其进一步发展提出可行建议。合理选择供销渠道，完善供需链，加强销售流程安全的内控监督，建立更有效的内部控制环境，并完善ERP应用实现进销存全面管理，通过采取这一系列积极措施，对于不科学的控制流程予以改造，提高企业的运营效率。ERP系统与内部控制拥有同样的目标，即令企业的经营效益得到提高，保证企业销售环节的正常运行，不断加强日常运作管理的标准化、流程化，进一步实现财务与业务流程的协同处理。因此，企业实施ERP后应完善和优化销售环节甚至企业整体的内部控制，以更好地促进企业实现内部控制目标，完成企业最大利润的实现。