野生型果蝇w1118的酵母双杂交cDNA文库及诱饵载体的构建

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果蝇有体积小,生命周期很短,子代数量多等特点,且果蝇的全基因组序列已测序完成,其基因序列与其他生物(特别是哺乳动物)有很高的同源性,同时,对果蝇的一些复杂生物学现象也有了深入的研究和认识。因此,果蝇成为目前最重要的模式生物之一,在遗传学、神经科学、人类疾病等研究领域起到非常重要的作用,其中黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的应用最为广泛,而野生型果蝇w1118就是黑腹果蝇的一种。构建野生型果蝇w1118的酵母双杂交cDNA文库,可以更为方便地研究果蝇中蛋白质与RNA、小分子物质以及蛋白质之间的相互作用。本实验采用 SMART(Switching Mechanism At 5’ end of RNATranscript)技术,在酵母菌Y187中构建野生型果蝇w1118的cDNA文库。提取野生型果蝇w1118的总RNA,对其进行凝胶电泳后清晰可见28S和18S两条带,说明总RNA的提取质量较高,以其为模板反转录获得第一链cDNA。以第一链cDNA为模板通过长距PCR(LD-PCR)扩增得到双链cDNA(dscDNA),将dscDNA进行凝胶电泳,其片段大小在500-2000bp之间,说明dscDNA质量较高,可用于转化酵母菌感受态Y187。dscDNA经纯化后,与线性化载体pGADT7-Rec共转化酵母菌感受态Y187,利用酵母细胞内同源重组形成文库质粒。在SD/-Leu营养缺陷平板上筛选并收集克隆,通过稀释法计算转化效率为5.5×105/3ug pGADT7-Rec,测定文库效价为1.42×107cfu/ml。通过菌落PCR计算重组率达到100%,插入cDNA片段的大小在300-2000bp之间,说明转入了大小不等的cDNA片段。以上实验结果说明本实验构建的cDNA文库质量较高,为后续酵母双杂交筛选受体蛋白提供了重要的材料和基础。同时,根据Flybase中基因CG2056的CDS序列设计引物,野生型果蝇w1118的总RNA经反转录合成cDNA,以此为模板通过PCR扩增基因CG2056,并利用该基因构建诱饵载体pGBKT7-CG2056。将诱饵载体pGBKT7-CG2056转化酵母菌感受态AH109,并进行自激活检测。结果显示诱饵载体pGBKT7-CG2056转化酵母菌感受态AH109后,无自激活反应,可以用于后续实验。
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