肝癌患者特异性基因的筛选

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背景:肝癌是生活中常见的恶性肿瘤,它的特点是复发率高、死亡率高,在世界范围内排名靠前。肝癌在我国屡见不鲜,每年都有数十万人死于肝癌,死亡率仅次于肺癌。因此,探索导致肝癌的发病机制显得极为重要。现已证明,无论是丙型肝炎病毒还是乙型肝炎病毒都是当今世界肝癌的主要病因。病毒引起肝癌,主要是因为在肝脏内发生大量炎症、纤维化和最终肝硬化。在丙型肝炎和乙型肝炎感染过程中,肝细胞内发生许多遗传和表观遗传变化,这是肝癌发生的一个主要因素。因此我们推测肝癌患者的免疫水平也发生了变化。此外,近年来,有大量的实验组对肝癌进行了全基因组或外显子组测序,筛选出了许多在肝癌发生中差异表达的基因,例如TP53、ARID1A、HULC还有Sox2ot等等,实验验证这些基因在肝癌患者中表达上调,在调节肝癌的发生方面有影响。尽管人们发现了很多在肝癌中差异表达的基因,但还是有很多起重要调节作用的基因未被发现。目的:本课题拟探讨在肝癌患者中相关淋巴细胞的表达变化,以及通过高通量测序技术筛选出在肝癌发生发展中起作用的特异性基因,以期找到基因治疗靶点及肝癌诊断指标。方法:1分离肝癌患者、普通健康人外周血的PBMC(人外周血单核细胞),通过流式细胞术分析患者淋巴细胞的变化来检测其免疫水平的变化。2通过提取患者癌和癌旁组织、患者和健康人的PBMC的RNA进行高通量测序,筛选出特异性基因。3通过RT-PCR、Real time-PCR等实验技术来验证所筛选出的特异性基因。结果:流式细胞术分析肝癌患者的PBMC,相比于正常健康人来说,其体内的T淋巴、NK和NKT还有B细胞表达增高,发现患者的免疫调节异常,产生抗肿瘤反应。可以通过对这些细胞的测定来诊断肝癌的发生以及对治疗效果的动态观察。高通量测序技术筛选出特异性基因XIST、FOXP1-AS1、HAGLR、DIO3OS和MEG3,Real-time PCR确定特异性基因FOXP1-AS1、HAGLR、和MEG3在肝癌中表达上调,证明其参与调节肝癌的发展进程,从而为肝癌在基因方向上的治疗提供新的靶点。结论:肝癌患者相比较于健康人,免疫调节异常,可作为诊断标志。同时,FOXP1-AS1、HAGLR和MEG3基因在肝癌患者中异常表达,呈现上调状况,可以为基因治疗的研究提供帮助。
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