重庆市荣昌县三奇寺水库是一座灌溉、防洪、供水的综合水利工程。以三奇寺水库为案例，开展农村典型地区水源地保护研究，以体制、机制、管理、技术为切入点，制定水源地保护实施方案，以满足水库集雨区居民的用水安全，保障区域水环境安全，具有较好的代表性与示范性。　　 三奇寺水库水源地保护的目标是改善三奇寺水库水源水质，使一级保护区水质标准常年保持在地面水环境质量标准(GB3838-2002)中Ⅱ类以上，符合生活饮用水卫生标准(GB5749-2006)的要求;二级保护区的水质标准常年不得低于GB3838-2002中Ⅲ类标准。有效提高应对三奇寺水库集雨区突发性水资源损害事件的能力，全面提高水源安全监测能力，建立三奇寺水库水源地保护长效管理机制，全面实施三奇寺水库水源地的监管，确保供水总体安全。　　 三奇寺水库的主要污染源为农田化肥、农户分散养殖和场镇生活污水，优先污染物为总磷、总氮，因此水源地保护重点（工程）任务为削减农田化肥、农户分生活污水的氮和磷。据此设计了散户污水削减工程、水源地清库工程、农田清洁生产工程、水源涵养工程、取水口保护工程、生态浮床（岛）修复工程、梯级跌水-渗滤-湿地修复工程、生态沟渠修复工程等8个重点工程和分级保护对策、能力支撑建设、风险应急对策以及长效机制建设等。　　 通过三奇寺水库水资源保护措施的实施，改善三奇寺水库水质，为周边乡镇居民生活提供优质水源，同时优化村落生态系统、森林生态系统、农田生态系统、湿地生态系统、沟渠生态系统、水域生态系统的结构与功能，为区域水资源保护提供有力保障。