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TNF α是炎症反应的一种主要介质,在许多疾病的病理过程中起着重要作用,抗TNF α抗体对这些病理过程能起拮抗作用,从而产生治疗效果。在早期工作中,我们曾从一株单克隆抗体杂交瘤克隆出抗TNF α抗体的轻、重链可变区基因并在大肠杆菌表达了其单链抗体(ScFv)和Fab抗体。为进一步提高其亲和力,本研究尝试多种突变方法,利用抗体库技术,建立体外抗体亲和力成熟流程,此流程将适用于其它工程抗体。 第一部份:随机突变提高噬菌体单链抗体的亲和力。首先对pscTNF单链抗体基因进行两轮错配PCR,构建突变库,库容为7×10~6。部份克隆测序显示碱基突变率为3.7%,氨基酸突变率为10.6%。这些突变有37%分布于CDR区,63%分布于骨架区。对此库进行四轮淘筛,获得了多株特异性结合克隆,有些结合能力有所提高,但亲和力改善不明显。为观察这些突变点重组后能否进一步提高亲和力,我们尝试了2种技术路线进行基因重组:其一,挑选了7个活性有所增强的变种克隆进行交替延伸PCR(StEP),使这7个变种的突变位点交换重组,构建变种库,经筛选和相对亲和力测定,获得了两株(S33和S41)亲和力进一步提高的克隆。其二,利用DNA交换(DNA shuffling)的方法,对错配PCR产生的突变进行重组交换,构建次级突变库,库容为1.12×10~7,从中筛选出一株(SP21)亲和力明显提高的抗体变种。第二部份:CDR3突变提高噬菌体抗体亲和力。我们尝试了CDR3部位的限定性突变,选择Fab噬菌体抗体,采用了两种策略,一种是在合成引物时控制每个位置不同碱基的掺入比率,使亲本残基出现的几率约为70%;另一种是对选定的残基按codon-based突变合成引物,使每个残基位置有50%的随机突变,其中重链CDR3较长,前后各5个残基分别突变,通过重叠延伸PCR的方法分别构建轻、重链共6个突变库。通过四轮淘筛,经测序和非竞争性酶免分析法测定亲合常数,从轻链突变库中筛出一株(K8)变种,其亲和力提高近28倍。从重链突变库中挑出10株序列不同的特异性克隆,亲和力提高近摘要2一65倍。然后将突变的轻链基因与突变的重链基因组合,以及重链CDR3区前后不同的突变点之间组合,经筛选后获得亲和力进一步提高的克隆。我们还尝试了CDR3部位的热点突变,对单链噬菌体抗体L一CDR3和H一CDR3中的热点序列进行随机突变,构建了库容为sxlo‘的变种库。通过4轮掏筛,得到一株(HOT68)相对亲和指数显著提高的抗体。 本实验共尝试比较了5种突变方法。从错配PCR库中没有获得亲和力有明显改善的抗体,在此基础上进一步通过DNA交换和交替延伸PCR使亲和力有了较明显提高。对CDR3的突变均得到了亲和力提高的克隆,其中CDR3热点突变只获得一株亲和力有显著提高的变种,对轻重链CDR3的限定性突变,获得了多株亲和力提高的变种,经轻重链突变的组合后,亲和常数最高提高近93倍。总体上分析,通过合成CDR3限定性突变引物引入突变效果最好,。 本工作得到了亲和力提高的抗TNF一a抗体,同时通过对不同突变方法的尝试比较,初步确定了抗体体外亲和力成熟的可行方案,为以后的研究奠定了基础。