蛋白质组分析条件的优化与弱精症患者精液比较蛋白质组学研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:honeypan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的优化基于MALDI-TOF-MS的蛋白质组分析条件,研究弱精症患者与正常生殖能力者精液中精子和精浆蛋白质表达差异,探讨弱精不育机制。方法在优化蛋白质组分析条件时,选取对蛋白组研究结果有较大影响的MALDI-TOF-MS分析条件、数据准确度、搜索引擎采用、数据库选择以及主要参数设置进行考察,用BSA数据来建立标准参数模型,以CAH2_BOVIN、Hsp70s数据为训练对象检验标准参数,最后获得优化的蛋白质分析条件。在弱精症患者精液比较蛋白质组学研究中,收集临床上确认的弱精症精液样本,分别制备精子和精浆;采用2-DE分离/银染检测差异表达蛋白策略进行图谱分析,对差异表达蛋白以胰蛋白酶(trypsin)酶解,肽段混合物经MALDI-TOF-MS鉴定获得PMF数据,MS-Fit数据库搜索,最终获得有关蛋白质的信息。结果1、以BSA质谱数据为研究对象,考察了经MALDI-TOF-MS获得PMF时分析条件及准确度对蛋白质数据库搜索结果的影响。2、以CAH2_BOVIN质谱数据为训练集建立模型,然后以人Hsp70s数据进行检验,优化了PMF鉴定蛋白质的生物信息学分析条件。3、以弱精患者精子/精浆为研究对象,在不同的条件下进行2-DE,获得了较高分辨率的凝胶图谱,同时分离得到的蛋白质点满足了质谱分析的要求。4、弱精患者组与正常组精子的比较蛋白质组学研究:与正常组比较,从弱精患者组精子样本中发现高度表达而正常样本中缺失或表达下调的27个蛋白点以及在正常精子中存在而在弱精不育精子中缺失或低表达的37个点,经PMF鉴定和蛋白质数据库搜索,初步找到了47相关蛋白质。5、弱精患者组与正常组精浆的比较蛋白质组学研究:从正常组样本中发现24个蛋白点高表达(3个在不育缺失),18个蛋白点在不育高表达(3个蛋白点在正常缺失),经肽质量指纹谱鉴定和蛋白质数据库搜索获得36个蛋白相关信息,并对EHD1、PSMA、KLC1和CDC25A等蛋白进行了Western blot确认。结论MALDI-TOF-MS的离子化是一种由基质介导的、复杂的固相/气相过程,分析条件的选择对后续蛋白质搜索结果的影响十分明显,合适的分析条件可以给实验结果带来高可信度。要获得正确的PMF必须高度重视质谱分析条件的选择与优化。质谱分析参数的选择包括质谱精确度的控制、激光强度的选择、加速电压的设定、延迟时间和激光击打次数的选择等。与经典的蛋白质研究不同,在蛋白质组学的研究工作中,是通过质谱数据与蛋白质数据库的比对来获得鉴定结果的,如果所获得的质谱数据有误差,或与蛋白质数据库比对时的参数设置不合理,将对搜索结果产生很大的影响。本研究的结果表明,Swissprot最适合于做PMF搜索的数据库;从搜索引擎来说,通过两个引擎进行搜索是较为合理的,这样可避免漏检和降低候选蛋白的误选几率;对漏切位点、质量容错数等参数的选择应根据研究要求进行优化。弱精患者的精子蛋白质组对应于蛋白质的转录、合成、转换、转运等环节,均出现了相关功能蛋白的上调或下调。精浆蛋白质组的差异表达蛋白大部分是跟精子发生、成熟过程有关的活性蛋白。在两种蛋白质组中,还发现了一批功能未知的蛋白。这些结果为后续研究打下了重要基础,从蛋白质组学的角度,为弱精不育研究创造了条件。
其他文献
研究背景: Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)家族是最具代表的模式识别受体,是先天性免疫系统的重要组成部分。大量研究证明TLRs参与了心肌缺血再灌注(ischemia/reperfu
近年来,随着溃疡性结肠炎(UC)发病率的不断升高,引起了医药界的广泛重视。中药在治疗UC上具有辩证灵活,疗效较,毒副作用小等优点,但落后的剂型制约了其疗效的充分发挥。结肠靶向给药是一个具有前景的给药方式,但目前,中药复方结肠靶向制剂研究较少,因此,中药复方结肠定位释药制剂的研究就显得尤为重要和紧迫。本研究选用结肠康复方,该方是根据中医理论和UC的病因病机,结合临床用药经验和前期研究结果选定的,由黄
高血压病是世界最大的流行病之一,是引起心、脑、肾等脏器常见并发症,成为半数以上致死的原因,防治高血压是防治心血管病的关键,是全球范围内的重大公共卫生问题。目前世界上高血
目的:参考《中国药典》2010版(一部)及相关文献记录的有关参芪通脉调糖片所含太子参、黄芪、山药、熟地黄等十五味药材的薄层鉴别和含量测定的方法,探索参芪通脉调糖片的薄层色谱
根据新闻出版总署《关于开展新闻记者证核发情况自查工作并重申有关规定的紧急通知》(《2009》299号)、《新闻记者证管理办法》、《关于2009年换发新闻记者证的通知》、《关
糖苷酶即糖苷水解酶,是一类以内切或外切方式水解各种含糖化合物中的糖苷键,生成单糖、寡糖或糖复合物的酶。它在自然界广有分布,对于维持生物体基本功能有着重要的意义。作为一种催化合成新型糖苷类化合物的工具酶,糖苷酶具有催化效率高、稳定性强、耐特殊条件、工业适应性强、价格适宜等特性,可以降低成本,提高产率,改进产品质量。黄芩糖苷酶能降解黄芩苷得到苷元黄芩素和葡萄糖醛酸,苷元的生物利用率高且具有更理想的生物
甘时勤先生离去了!2010年3月下旬的一天,当噩耗传来时,我竟不敢相信!其实我对甘时勤先生没有多少了解,也没有深交。我第一次听说“甘时勤”这个名字,也不过是在三年 Mr. Gan
趋化因子类似物受体1(CMKLR1,ChemR23)是一类具有七次跨膜结构的G蛋白偶联受体,可以与chemerin及其衍生的九肽(C9)结合发挥细胞功能。近期有研究发现淀粉样蛋白β的1-42位肽段同样可以与CMKLR1结合。鉴于CMKLR1的不同配体不存在序列同源性,我们拟通过使用稳定表达CMKLR1的细胞系来探究它们作用于CMKLR1的药理效应。Aβ42和C9与CMKLR1结合后都可以引起受体的
不管你是喜欢它的新奇,还是厌恶它的喧闹,名人占领媒体版面的趋势已无法阻挡。不是人们的内心阴暗,眼下所有的一流、二流和“没流”明星们曝光在媒体上时,如果缘由不是某部作
今年以来,我市侨务宣传工作坚持“对内宣传侨务,对外宣传连云港”的指导思想,全力推动侨务宣传工作再上新台阶。据统计,1-8月份,我办会同有关县区、部门共在《国际日报》、《