论文部分内容阅读
第一部分结直肠癌组织中差异表达miRNA的筛选及其调控靶基因的确定 目的:研究结直肠癌中全基因组水平上miRNA-mRNA相互调控关系，明确结直肠癌中差异表达的miRNA下游的靶基因及其调控的信号通路。方法:利用miRNA芯片及mRNA芯片确认结直肠癌组织中miRNA及mRNA表达谱;应用Pearson相关性分析，选取表达水平呈明显负相关的miRNA-mRNA对，通过生物信息学筛选具有直接调控关系的miRNA-mRNA对，分析其参与的信号通路。应用realtimePCR及细胞实验验证预测结果。结论:通过芯片分析，共筛选出32个差异表达的miRNA及2916个差异表达的mRNA，应用芯片表达水平相关性分析及靶点预测软件共筛选出72对表达水平呈明显负相关的miRNA-mRNA对。其中包括22个差异表达的miRNA及58个差异表达mRNA，通过信号通路分析表明wnt通路可能受这些差异表达的miRNA调控。realtimePCR在40例样本中对miRNA及mRNA表达水平进行验证，结果与芯片结果一致。细胞实验发现KLF4可能是mir-29a的靶基因。 结论:本研究共预测了在结直肠癌中miRNA-mRNA调控网络，确认了结直肠癌中差异表达的miRNA的靶基因，为进一步机制研究提供线索。 第二部分:Mir-29a通过调控KLF4参与结直肠癌肝转移的研究 目的:研究mir-29a在伴有肝转移的结直肠癌组织中表达水平，探讨其与临床病理特征的联系，明确mir-29a在结直肠癌组织中表达水平与KLF4蛋白表达水平的相关性。方法:在68例结直肠癌患者中应用realtimePCR检测mir-29a表达水平，应用组织芯片检测结直肠癌组织中KLF4表达水平。结论:mir-29a在伴有结直肠癌肝转移患者中表达水平明显上调，KLF4表达水平在伴有肝转移及淋巴结转移的患者中下调，mir-29a在结直肠癌中的表达水平与KLF4负相关。 结论:mir-29a在伴有肝转移的结直肠癌组织中表达上调，其表达水平与KLF4蛋白负相关，对mir-29a或KLF4的干预可能是结直肠癌肝转移的治疗靶点。