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目的:了解耐多药结核分枝杆菌中耐利福平表型与基因型的关系,以及结核分枝杆菌耐利福平机制。方法:对结核病患者临床标本进行抗酸染色涂片、细菌培养、菌型鉴定及药敏试验,筛选耐多药结核分枝杆菌并获取其耐药表型数据。提取菌株DNA,分别对耐利福平相关基因rpo B、rpo C、rpo A及rpo Z基因编码区全长进行PCR扩增和测序,获得菌株耐药基因型信息。测序结果在NCBI数据库中与结核分枝杆菌标准菌株H37Rv序列进行比对,并分析结果。结果:本研究的71例耐多药结核分枝杆菌菌株中,65例(91.5%)发生耐利福平相关的基因突变,包括rpo B、rpo C和rpo A多个基因的突变,无rpo Z基因突变,6例无上述4个基因突变。65例突变株均出现rpo B基因突变,其中63例(88.7%)发生在rpo B基因中利福平耐药决定区(RRDR)内,以531(54.9%)、526(14.1%)及516(9.9%)位点突变为主;2例单独出现RRDR外基因突变;63例中有7例出现RRDR内与RRDR外联合突变。65例突变株中,27例(38.0%)发生rpo C基因突变,3例(4.2%)发生rpo A基因突变。rpo C及rpo A基因突变的菌株均同时在rpo B基因发生突变,即双基因联合突变。本研究共发现11种结核分枝杆菌耐利福平相关基因新型突变,包括7种rpo B基因突变:CCG126TCG、CTG511CCC、TCG574TAC、TCG663GCG、GGC747GAC和GTG250GCG/GTC251TAC联合突变;4种rpo C基因突变:GAG49GCG、GGC332TGC、CCG434ACG及GCC710AC。结论:耐多药结核分枝杆菌中耐利福平机制主要与rpo B基因(特别是RRDR内)突变有关,而rpo B基因RRDR外部分区域、rpo C及rpo A基因可能作为rpo B基因补偿基因。本研究发现11个耐利福平相关基因新型突变,为进一步研究结核分枝杆菌耐利福平机制奠定实验室基础。