专利制度在我国已运行二十年,它促进了我国的科技创新、文化发展和市场繁荣。拥有专利能提升企业竞争力,取得企业竞争制高点的观点已被世人所认知。随着我国企业对专利认识的深入,必将有越来越多的企业认识到专利运作的重要性并实施专利运作。然而,按照风险的一般理论,风险是客观存在的,专利运作从最初阶段的查新研发到推向市场有很大的不确定性,存在着风险的隐患。帮助企业客观地认识专利运作风险,防患于未然,提高企业专利运作成功率,是理论界的一项重要课题。基于此,本文开展对专利运作风险的理论探讨。本文以管理学理论、知识产权理论、风险理论、系统理论等相关学科理论为依理,将企业专利运作视为一项系统工程,对专利运作风险从理论上进行了界定,通过分析专利运作风险因素和形成机理,对专利运作风险形成总体的认识,并将风险因素按企业可控度作了比较说明。本文将专利运作划分为专利查新、专利研发、专利申请、专利市场化几个阶段,分别探讨了专利运作各个阶段风险识别的方法,风险的成因、特点,并针对各个阶段的风险分别从风险防范和风险处理两个方面提出企业可采取的风险防范管理措施。在文中,创新性地探讨了基于专利申请风险防范的企业专利申请流程机制的建立和其可采用的沟通措施。同时就专利文化和专利防范机制的建立作了相关的探讨。