结肠癌细胞VCR耐药株的建立及相关miRNA筛选

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背景肿瘤细胞耐药是导致肿瘤化学治疗失败的重要原因,长春新碱(vincristine, VCR)是一类广泛用于肿瘤治疗的化学药物。但是,长期使用可使肿瘤细胞对VCR产生耐药性,肿瘤耐药机制仍不清楚。本研究探讨与结肠癌耐药的微小RNA(microRNA, miRNA),旨在揭示肿瘤耐药机制及为肿瘤细胞耐药逆转提供基础。目的建立长春新碱耐药结肠癌细胞模型,筛选与结肠癌细胞VCR耐药相关的miRNA。方法1.培养结肠癌HCT-8细胞,采用VCR梯度诱导,建立HCT-8/VCR耐药细胞株。2.采用全基因组筛选的研究策略,运用HiSeq 2500测序技术和生物信息学的方法,检测和分析耐药HCT-8/VCR细胞的和非耐药的HCT-8细胞差异性表达的miRNAs,构建其miRNA的差异表达谱。3.针对鉴定的差异miRNA,通过靶基因预测软件进行靶位点确认,通过靶基因所在基因的GO进行功能注释。结果1.利用浓度梯度的VCR建立了VCR耐药的结肠癌细胞HCT-8/VCR, HCT-8/VCR细胞在2×103ng/mLVCR中生长良好。2.共进行了1651种miRNA测序,其中有差异的有48种miRNA,与非耐药的结肠癌HCT-8细胞相比,24种miRNA差异具有统计学意义(P<0.05),其中有17种miRNA表达上调(P<0.05)。hsa-miR-675-3p表达量上调最高,高达7.497681倍,其次是hsa-miR-100-3p, hsa-miR-125b-1-3p, hsa-miR-582-5p, hsa-miR-3141, chr1510055, hsa-miR-582-5p, hsa-miR-582-3p, hsa-miR-3687。7种miRNA表达下调(P<0.05),下调最高的是hsa-miR-146a-5p,下调7.75199倍,其次是hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-181 a-3p, hsa-miR-1247-5p。结论]miRNA的异常表达与结肠癌细胞VCR耐药相关。miRNA表达量的差异可能在结肠癌细胞VCR耐药中起关键作用。
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