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HSV-1复制区与宿主蛋白相互作用HSV-1是一类DNA病毒,感染上皮细胞后进入裂解感染,在裂解感染过程中HSV-1控制了细胞核,转录表达病毒RNA和蛋白,进行复制和病毒体组装。转录和复制过程中的HSV-1形成结构性的区域,其转录复制区域被高度有序的组织。HSV-1利用细胞内的转录复合体和染色质蛋白调控自身基因表达,对抗宿主细胞对病毒的抑制。HSV-1转录复制区域对宿主蛋白招募或排斥。我们发现HSV-1对组蛋白H3K4me3,H3K27me3,H3K9mc3,H3S10p和γH2A.X有排斥作用,对没有修饰的总的组蛋白影响不大。RNA聚合酶Ⅱ(RNA PolⅡ)在病毒DNA结合是动态的。RNA PolⅡ,RNA PolⅡ ser2p和RNA PolⅡ ser5p在病毒感染初期都被招募到HSV-1转录区域;随后,在转录区域的RNA PolⅡ和RNA PolⅡser2减少,而RNA PolⅡ ser5一直存在。复制中心还会招募DNA损伤修复(DNA damage repair,DDR)相关的蛋白ATM,53BP1,BRCA1和降解后的抗病毒组分SP100;降解泛素化酶RNF8和RNF168。HSV-1复制中心需要宿主染色质结构调控蛋白CTCF和cohesin的大量参与。 宿主蛋白CTCF与HSV-1裂解感染染色质结构组织蛋白CTCF参与染色质界限,绝缘子和DNA环这样的高级结构形成和维持。我们之前的ChIP-seq数据表明CTCF可以结合在裂解期感染的HSV-1基因组上,结合位置包括病毒基因内部和启动子。我们用超分辨显微镜技术发现CTCF位于HSV-1复制区区域。DDR组蛋白γH2AX位于复制区外围,形成笼子一样的结构包裹在病毒外面。敲低CTCF后,HSV-1转录,复制和病毒产量下降,病毒基因和启动子上的异染色质组蛋白H3K27me3结合增加,RNA PolⅡ结合减少;CTCF敲低后,γH2AX渗透进入复制区。 CTCF在DNA损伤修复中的作用CTCF突变会引起人类小头畸形症(microcephaly)和智力低下,这些症状和许多DNA损伤修复蛋白基因突变引起的疾病非常相似;条件敲除CTCF,能够引发小鼠神经元缺失并阻断淋巴细胞的增殖和分化,增加肿瘤发生的机会;CTCF还可以帮助细胞抵抗凋亡和UV带来的伤害;CTCF的结合位点很多与三核苷酸串联重复(Trinucleotide repeat)邻近,并且与其稳定性密切相关。然而现在已报道的CTCF的功能都不能清楚地解释这些现象。 我们研究了CTCF在DNA损伤修复中的可能发挥的作用。我们发现CTCF在APH诱导下结合基因组fragile位点,敲低CTCF诱导细胞发生双链DNA断裂,激活细胞DNA损伤修复应答反应,并降低DSB修复效率。CTCF依赖ATM和NBS途径及其锌指结构被DNA损伤区域招募。