在我国目前的股权结构背景下,大股东能以其特殊的控股地位左右上市公司经营政策,使其按大股东利益最大化的目标进行关联交易定价,充分运用关联交易的负面作用,侵占上市公司的利益。大股东的这种行为严重影响了上市公司的正常经营活动,损害了投资者的信心。如何抑制大股东对上市公司的侵害,保证上市公司健康有序的发展是目前我国证券市场亟待解决的一个问题。本文采用规范研究与实证分析相结合的方法。在理论分析中,从分析关联交易与大股东侵占行为产生的根源和原因入手,采用例证法对大股东侵占上市公司利益的主要手段及方式进行了研究。在实证研究部分,以深市2003-2005年符合要求的上市公司作为研究样本,通过建立计量经济学模型,将大股东侵占行为指标与股权结构指标、公司治理结构指标进行多角度的回归分析,以期得到股权结构对大股东侵占行为影响的关系。数据结果表明,控股股东和上市公司之间的关联交易规模与控股股东持股比例呈显著的正相关关系,控股股东持股比例与上市公司的经营性资金被占用率呈倒“U”型关系;第二大股东对于抑制控股股东与上市公司之间的关联交易规模具有一定的作用;当控股股东为国有企业控股时要比非国有企业控股更容易发生大股东侵占行为。最后根据本文的研究结果,从制度根源、公司治理结构和相关法规方面提出了相应的政策建议。