麦穗鱼属(Pseudorasbora)隶属于鲤形目(Cypriniformes),鲤科(Cyprinidac),绚亚科(Gobioninae)。中国有记载的麦穗鱼属鱼类有麦穗鱼(Pseudorasbora parva)、断线麦穗鱼(Pseudorasbora interrupta)和长麦穗鱼(Pseudorasboraelongate)3种。其中麦穗鱼(P.parva)在国内广泛分布,包括香港岛和台湾岛,越南北部、朝鲜半岛和日本也有分布,此外由亚洲引入欧洲多个地区；断线麦穗鱼只分布于广东省潮州市的凤凰山天池；长麦穗鱼主要分布于西江水系及长江下游地区。麦穗鱼属在日本有分布的是P.parva、P.pumila pumila及P.pumila subsp等。　　 本研究从辽河、长江、钱塘江、珠江、闽江、日本和台湾部分水系,以及广东凤凰山天池等十多个采样点共采得八十多尾麦穗鱼,分别属于麦穗鱼、断线麦穗鱼、P.pumila、P.pumila pumila四个种或亚种。通过解剖、X光拍照和形态度量分析等形态学研究方法,以及细胞色素b基因全序列、16S等线粒体DNA序列分析方法,结合亚洲地史事件分析麦穗鱼属物种分化及亲缘地理关系,我们得出了以下结果:　　 1.形态研究显示,麦穗鱼和断线麦穗鱼在侧线鳞数目、体侧框架结构、颌骨、鳔室形态上差异明显。　　 2.基于mtDNA的Cytb基因、D-loop和COⅠ基因部分序列的单倍型系统发育树显示,麦穗鱼和断线麦穗鱼有着很近的亲缘关系。断线麦穗鱼10个样本Cytb基因只检测到一个单倍型,断线麦穗鱼和荔浦、仁化、锦屏、全州、开化、闽江的麦穗鱼的部分样本共享一个单倍型。　　 3.日本的麦穗鱼和中国的种群在系统发生树上成为一个单系群,但与中国各水系的麦穗鱼分化较大。中国的麦穗鱼和断线麦穗鱼聚为另一枝,这枝又分为A群和B群。A群包括长江以北的辽河和黄河与台湾水系聚为一枝。B群包括长江和长江以南的珠江、闽江、钱塘江水系的样本聚为另一枝。中国麦穗鱼的分布呈南北分化,AMOVA分子变异分析显示麦穗鱼种群存在地理障壁。　　 根据以上结果得出:麦穗鱼和断线麦穗鱼存在明显形态差异,基于线粒体DNA的单倍型系统发育树显示麦穗鱼和断线麦穗鱼的亲缘关系较近。日本的麦穗鱼和中国的种群已有了较大分化,中国的麦穗鱼存在地理隔离差异。