淡水木腐真菌不仅作为分解者对自然界中淡水生态系统及物质循环起着重要作用,而且也是重要的生物资源,具有巨大的应用潜力。本文主要主要在江西南昌江西农大后山、梅岭风景区,九江,宜春丰城等地的水沟、池塘、小溪、河流和湖泊等环境中采集若干份样品,定点定量选取130份有效淡水沉积腐木样品,采用培养法分离样品上的真菌纯培养物,并进行分子系统发育研究辅以形态学研究,得到如下结果:1.本研究从采集选取的130份有效淡水沉积腐木样品上,分离获得培养物获得392株,已测序的340株菌鉴定出真菌63属,128种。2.本研究初步选取江西省南昌（NC）,九江（JJ）,宜春（YC）三个城市点选取样品30份,在每份腐木样品上选五个点刮取木屑分离真菌培养物,分离获得真菌培养物249株（NC组:样品10份,菌株60株;JJ组:样品10份,菌株86株;YC组:样品10份,菌株50株）,目前已鉴定196株中,有5门,5亚门,10纲,9亚纲,21目,27科,45属,90种。其中7个优势属为Trichoderma、Penicillium,Fusarium,Arthrinium,Mortierella,Saprolegnia,Talaromyces,每个属在本研究中至少鉴定出3种,4个优势种为Saprolegnia australis,Paecilomyces aerugineus,Talaromyces diversiformis,Talaromyces aerugineus,其检出频率至少达到了16%。3.在南昌市梅岭风景区神龙潭（脚鱼潭）溪流选取样品100份（50份沉水腐木,50份岸边陆生腐木）,在每份腐木样品上选五个点刮取木屑分离真菌培养物,分离获得真菌培养物141株,进一步研究了溪流及岸边真菌,通过对两个采样点的生态数据分析,并对比相关研究表明,水生真菌的多样性指数H’是3.1469,岸边陆地真菌的多样性指数H’是3.3534,显示了水生真菌多样性显著低于岸边陆生真菌多样性,水陆两种生境都存在的真菌不达真菌种类的总数的23.33%,相似性指数S’为0.3784,显示了两个采样点较低的真菌群落相似性。江西省是淡水真菌研究相对滞后区域,但是物种多样性丰富。所以,对于江西地区来说,值得我们用更多样的研究方法去更全面搜集淡水真菌资源。本研究的目的是调查江西省淡水真菌的多样性,发掘和收集淡水真菌种质资源,为后续的研究提供鉴定依据和文献参考、奠定基础。