基于两阶段视角,论文首先运用基于松弛变量的数据包络分析模型(SBM)对2005—2016年中国29个省域高技术产业的研发绩效与成果转化绩效动态变化趋势和省域差异进行量化研究,并利用探索性空间数据分析(ESDA)方法中的全局空间自相关分析、空间自相关散点图分析和局部聚类和异常值分析直观展示两阶段创新绩效的时空演变分布格局,最后构建删失面板模型(Tobit)分析了两阶段创新绩效的主要影响因素。研发绩效与成果转化绩效研究发现:高技术产业技术创新绩效值总体偏低,多数省域两阶段绩效均处于低位区间,改进和提升空间很大。研发绩效均值基本显著高于成果转化绩效均值,两阶段效率失衡问题十分突出。中部和西部地区高技术产业研发绩效平均水平与成果转化绩效平均水平均低于东部地区,但近几年,东中西三大地区高技术产业研发绩效与成果转化绩效的差异逐渐缩小。探索性空间数据分析(ESDA)结果显示,中国高技术产业两阶段创新绩效的地域性特征显著,表现为局部呈现出高值或低值地区集聚和个别地区与邻近地区创新绩效水平不协调的特点,两阶段区域创新绩效局部空间关联模式表现为四种类型。研发阶段创新绩效在考察期里呈现出H-H集群由个别东部沿海地区逐渐扩散,形成东部沿海H-H集群和西南内陆H-H集群;而L-L集群由西部地区逐渐转移,形成东北L-L集群和西北L-L集群。同时高-低(H-L)集群和低-高(L-H)集群主要分布在中部地区和东中西邻接地区,创新绩效差异的空间过渡特征明显。成果转化阶段创新绩效则形成高-高(H-H)集群主要集中在东部沿海地区,逐渐向中部地区辐射蔓延;低-低(L-L)集群地区位于中部和西部地区,随着时间的推移,中部地区成果转化绩效低值地区逐渐减少。中国高技术产业两阶段创新绩效的影响因素分析结果显示:技术研发阶段,高技术产业中企业规模和对外开放度对研发创新绩效具有显著正向影响,而市场结构和外商直接投资占比对研发创新绩效具有显著负向影响。成果转化阶段,高技术产业中企业规模和对外开放度对成果转化创新绩效具有显著正向影响,市场结构对成果转化创新绩效具有显著负向影响;外商直接投资占比对成果转化创新绩效影响不显著。最后本文提出强化产学研用深度融合、加大市场化改革力度和加快区域协同创新机制建立,有利于科学配置高技术产业的创新要素,提升创新绩效,缩小地区发展差距,实现高质量协调发展。