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木霉属真菌在世界范围内分布广泛，物种丰富，是重要的可再生资源，部分种己被用于酶制剂生产、生物防治以及环境保护等领域。本研究旨在对中国土壤中木霉属真菌的物种多样性进行调查，了解中国该类群真菌资源的家底，在此基础上完善对物种之间的系统发育关系的认识，为资源的利用提供理论依据。 本研究从中国23个省区收集的782份土壤样品中分离木霉菌株982株。采用形态学和分子系统学方法相结合进行系统分类研究，鉴定出木霉属真菌85个种，其中包括42个新种[适应木霉（Trichoderma.adaptatum）、聚集木霉(T.aggregatum)、白绿木霉（T.alboviride）、山地木霉（T.alpinum）、版纳木霉(T.bannaense)、北京木霉(T.beijingense)、二叉木霉（T.bifurcatum）、短梗木霉(T.breve)、短粗木霉（T.brevicrassum）、棉絮状木霉（T.byssinum）、长白木霉(T.changbaiense)、厚垣孢木霉（T.chlamydosporicum）、同心纹木霉（T.concentricum）、聚梗木霉（T.confertum）、二型木霉（T.dimorphum）、灵芝木霉（T.ganodermatis）、密集木霉（T.gregarium）、海南木霉（T.hainanense）、河北木霉(T.hebeiense)、衡山木霉（T.hengshanicum）、毛状木霉（T.hirsutum）、湖南木霉（T.hunanense）、异味木霉（T.ingratum）、稀梗木霉（T.liberatum）、林芝木霉（T.linzhiense）、长孢木霉（T.longisporum）、莽山木霉（T.mangshanicum）、多孔菌木霉(T.polypori)、霜状木霉（T.pruinosum）、假密梗木霉（T.pseudodensum）、韶关木霉(T.shaoguanicum)、神农架木霉（T.shennongjianum）、四川木霉(T.sichuanense)、简单木霉(T.simplex)、孤独木霉（T.solum）、慢生木霉（T.tardum）、西藏木霉（T.tibetense）、曲毛木霉（T.undatipile）、轮枝木霉（T.verticillatum）、普通木霉（T.vulgatum）、黄木霉（T.xanthum）、察隅木霉（T.zayuense）]和7个中国新记录种。 采用rpb2和tef1序列联合分析的方法，探讨了包括新种在内的木霉属310个种的系统发育关系。结果显示，具有绿色子囊孢子的种和无色子囊孢子的种分别聚类在一起，形成了17个主要分支，其中Spirale为新建分支。选取47个菌株，采用ITS、rpb2和tef1序列联合分析的方法，探讨了T.harzianum复合种中各个种之间的系统发育关系，表明中国存在6个种，其中包括3个可能的新种。研究中，获得1500余个DNA序列片段(acl136个、ITS982个、rpb2260个、tef1260个)，其中200余个已提交GenBank。