利用CRISPR/Cas9在Bel-7402细胞中靶向敲除SMYD3基因的初步研究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:web198702
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:1.设计三个靶向于SMYD3基因的sgRNA。分别记为sgRNA#1、sgRNA#2和sgRNA#3。2.构建sgRNA#1-PX459、sgRNA#2-PX459和sgRNA#3-PX459重组质粒。3.检测SMYD3蛋白在HEK293T细胞和Bel-7402细胞中的表达情况。4.探索Lipofectamine?2000:1μg的sgRNA-PX459重组质粒最佳的包裹比例。5.比较不同浓度嘌呤霉素分别作用于HEK293T细胞和Bel-7402细胞,确定三天时最低致死浓度。6.比较CRISPR/Cas9打靶载体的活性。7.制备SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株。8.比较SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株与野生型Bel-7402细胞的增殖能力。9.比较SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株与野生型Bel-7402细胞的迁移能力。方法:1.在GenBank网站,搜索人SMYD3基因序列。在http://crispr.mit.edu/网站,设计靶向于SMYD3基因的sgRNA。2.使PX459质粒线性化,把sgRNA连接入线性化的PX459,构建sgRNA-PX459重组质粒。3.用不同体积的Lipofectamine?2000分别对1μg sgRNA#1-PX459、sgRNA#2-PX459和sgRNA#3-PX459重组质粒进行包裹,琼脂糖凝胶电泳分析最佳的包裹比例。4.用不同浓度的嘌呤霉素分别作用于HEK293T细胞和Bel-7402细胞,连续作用三天,显微镜观察,确定作用三天时最低致死浓度。5.分别用sgRNA#1-PX459、sgRNA#2-PX459和sgRNA#3-PX459重组质粒转染HEK293T细胞,PCR产物测序,确定CRISPR/Cas9打靶载体的活性。6.通过极限稀释法获得Bel-7402单克隆细胞株。7.通过Western Blot检测单克隆细胞株的SMYD3蛋白的表达情况。8.对无SMYD3蛋白表达的Bel-7402单克隆细胞株进行PCR产物连接TA载体测序,确定SMYD3基因缺陷型Bel-7402单克隆细胞株。9.通过CCK-8实验比较SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株与野生型Bel-7402细胞的增殖能力。10.通过划痕实验比较SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株与野生型Bel-7402细胞的迁移能力。结果:1.设计了三个靶向于SMYD3基因的sgRNA,其基因序列如下:2.使用不同体积的Lipofectamine?2000进行包裹DNA实验,确定sgRNA#1-PX459:Lipofectamine?2000最佳包裹比例为1μg:3μl,sgRNA#2-PX459:Lipofectamine?2000最佳包裹比例为1μg:3μl,sgRNA#3-PX459:Lipofectamine?2000最佳包裹比例为1μg:3μl。3.不同浓度嘌呤霉素分别作用于HEK293T细胞和Bel-7402细胞,作用三天时HEK293T细胞最低致死浓度为2μg/ml,Bel-7402细胞最低致死浓度为17μg/ml。4.PCR产物测序,确定CRISPR/Cas9打靶载体的活性。结果表明:sgRNA#1-PX459有活性,sg RNA#2-PX459和sgRNA#3-PX459没有活性。5.应用极限稀释法,共获得42株Bel-7402单克隆细胞株。6.Western Blot检测表明,编码#23号单克隆细胞株没有SMYD3蛋白表达。7.测序结果表明:编码#23号单克隆细胞株只有一种测序类型,获得SMYD3基因缺陷型Bel-7402单克隆细胞株。8.划痕实验表明SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞比野生型Bel-7402细胞的迁移能力弱。9.CCK-8实验表明SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞比野生型Bel-7402细胞的增殖能力弱。结论:1.成功构建一种靶向于SMYD3基因的打靶载体sgRNA#1-PX459重组质粒。2.Western Blot和TA克隆测序结果表明编号#23号单克隆细胞株为SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞株。3.SMYD3基因缺陷型Bel-7402细胞和野生型Bel-7402细胞相比,增殖,迁移能力减弱。
其他文献
针对气井产水问题,目前国内采用的方法很多,然而最有效的方法是进行排水采气工艺技术,将井底积液排出地面。通过现场应用,常规排水采气工艺技术都不能有效地排出井底积液,而
绝经后卵巢胚胎癌1例报告高国兰1彭芝兰1姚先莹21.附属第二医院妇产科教研室(成都610041);2.附属第一医院病理科1临床资料患者,女,65岁,孕4产2+2,绝经10年。因发现右下腹包块1月,腹胀半月于1990年6月14日入本院住院治
不考虑幕式排烃的情况下,油气在储层中运移和聚集过程中所受到的阻力主要是毛细管力的作用。以钻井、测井资料为依据,通过对沾化凹陷成藏期馆陶组下段埋深、孔隙度及渗透率的
基于ARM9嵌入式MCU设计并制作了闪烁参数测量系统,利用该系统对激光在实际湍流中的闪烁指数进行实验测量.在实际测量中,证明该系统能实时地测量激光在湍流大气中传输的闪烁指
随着Internet/Intranet技术的发展和普及 ,Web数据库已逐步取代基于传统的Client/Server模式的数据库系统 ,因此对于基于Web的数据库安全管理技术的研究具有实际意义。介绍了
以"瘦肉精"专项整治为例为进行分析后表明,运动式治理的常态化是有其内在机理和深层根源的。运动治国的路径依赖、资源匮乏的现实限制、议程设置的政策产出共同构成了运动式
缩略是现代汉语新词语形成的有效途径之一。从认知构式语法的视角对缩略词语与原有词语之间映射关系的考察显示,缩略词语的形成并非任意的和无条件的,而是有一定的动因且受认
近年来,能耗、环保、排放是汽车工业发展遇到的三大问题,而汽车轻量化是解决这些问题的有效方法和手段。铝是轻量化的首选材料。汽车的轻量化要求以及铝合金与钢铁件的可替换
提出了一种基于纠错(EC)延后的量子密钥分发协商协议.该协议不直接对密钥进行EC,而是将EC延后到信息交换后进行.这种量子密钥分发协商协议具有两个优点:1)EC延后可使量子密钥
"中国体验"是改革开放30年来,在社会变迁的大背景下,中国人在价值观和社会心态方面发生的微观变化。有关"中国体验"的叙事说明,仅仅研究"中国经验"即中国社会几十年来在宏观