葡萄(Vitis vinifera L.)隶属于被子植物门(Angiospermae)、双子叶植物纲(Dicotyledons)、蔷薇亚纲(Rosidae)、鼠李目(Rhmanales)、葡萄科(Vitaceae)、葡萄属(Vitis),其栽培历史悠久,是世界上最早种植的园艺作物之一。利用SSR分子标记、ISSR分子标记和叶绿体的trnL-trnF非编码区序列,分析了烟台张裕酿酒集团所属卡斯特酒庄葡萄种质园内的部分葡萄种质的遗传多样性和系统发育关系,旨在为葡萄种质资源的保护、管理和育种提供科学的理论依据。主要研究结果如下:利用19个SSR标记对49份葡萄种质的遗传多样性及系统发育关系进行了分析,共检测到了 139个多态性位点,平均每对SSR引物能扩增出7.32个多态性位点。平均有效等位基因数、Nei’s 基因多样性和香农信息指数分别为1.5605、0.3352和0.5064。UPGMA法聚类分析将这49个葡萄材料分为5个组和一个外类群。主成分分析的结果与UPGMA的结果几乎是一致的。利用13个ISSR标记对36份葡萄种质的遗传多样性及系统发育关系进行了分析,13个ISSR引物共产生了 63条带,平均有效等位基因数、Nei’s基因多样性和香农信息指数分别是1.5827、0.3463和0.5172。基于UPGMA法的聚类分析将36份葡萄材料分为6个主要的组群。ISSR与SSR的聚类结果并不完全一致,原因可能是二者的分类原理不同。基于叶绿体trnL-trnF序列对葡萄种质的遗传多样性和系统发育关系进行了分析,葡萄在叶绿体的trnL-trnF区域有较高的遗传多样性水平(Hd = 0.667,Pi =0.00206)。中性检验表明,葡萄的进化历史过程中发生过种群扩张事件。三种研究方法都表明葡萄种质资源具有较高的遗传多样性水平,遗传背景复杂。虽然不同的分析方法得到的进化树结果并不完全一致,但都证实了分子标记技术在葡萄资源研究上的高效性和稳定性。