心脏黏液瘤起源和发生的相关因素研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bittercoffee456
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目的:通过人类雄激素受体基因分析(human androgen receptor gene analysis,HUMARA)对心脏黏液瘤以及正常心脏组织进行X染色体失活类型分析,判断心脏黏液瘤(cardiac myxoma,CM)的克隆起源状态;并通过对心脏黏液瘤组织进行全基因组测序,对心脏黏液瘤基因行单核酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和拷贝数异常(copy number variation,CNV)分析,找到参与肿瘤发生中可能存在重要作用的SNP位点和CNV事件。方法:随机选取28例女性黏液瘤患者,分别提取28个心脏黏液瘤组织及正常心脏组织DNA,经甲基化敏感的Hhal酶消化,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增X染色体上HUMARA,产物经聚丙烯凝胶电泳银染显示其长度多态性,从而判断其克隆状态;再随机选取14例黏液瘤患者(男女不限),提取肿瘤组织DNA,通过全基因组测序进行基因水平SNP位点分析和CNV检测,并将14个标本按照肿瘤直径大小分为2组,比较检测结果在两组中有无差异。结果:28个病例标本中杂合子25个,杂合率为89.3%。心脏黏液瘤组22个标本呈多克隆起源,占88%(22/25);正常组织组24个标本呈多克隆起源,占96%(24/25)。两组之间比较,差异无统计学意义,Fisher’S确切概率法P>0.05;14个测序样本中检测到SNP位点相对应的高可信度肿瘤基因37个,其中18个位点突变率>10%,TP53、EP300、CREBBP起着核心连结作用,GO富集结果显示突变基因在细胞分泌调控上有显著性差异,KEGG富集结果显示PI3K-AKT和JAK-STAT信号通路在黏液瘤发生中也有显著性差异。另外SNP检测中发现具有高度突变影响的肿瘤基因新突变位点17个。同时检测到样本中120个肿瘤基因存在CNV事件,其中10个肿瘤基因同时被两个肿瘤数据库收录。GO富集显示微管发生以及细胞增殖调控等结果均存在显著性差异,KEGG富集显示综合的肿瘤信号通路存在显著性差异。按照肿瘤直径大小分为两组,ERCC6L和INTS6L基因CNV差异有统计学意义,Fisher’S确切概率法P<0.05。结论:心脏黏液瘤为多细胞克隆起源肿瘤,该肿瘤复发可能与其呈多克隆起源有关;心脏黏液瘤发生过程中存在多个肿瘤基因SNP位点突变,其中TP53、EP300、CREBBP等多个核心的肿瘤基因间存在相互作用关系,并通过PI3K-AKT和JAK-STAT信号通路调控肿瘤细胞,在肿瘤发生中起重要作用;同时在肿瘤发生过程中,亦存在多个肿瘤基因的拷贝数异常,其中ERCC6L和INTS6L基因拷贝数异常在以肿瘤直径大小分组中存在明显差异,提示这两个基因拷贝数异常可能与肿瘤生长状态相关。
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