背景:桥本甲状腺炎(Hashimoto’s Thyroiditis,HT)是一种器官特性自身免疫性甲状腺疾病,可能的发病机制主要与遗传、免疫和环境因素有关,但具体的分子机制还不是特别明确。传统研究分子机制时对蛋白质功能研究一般是在已有工作基础上某几个蛋白进行分析,可能存在主观性、片面性和低效率性。随着技术的更新,蛋白质组学技术成为后基因组研究的重要部分。差异性蛋白质组学能通过比较样本间蛋白质表达水平的变化,从整体上研究与疾病相关的差异蛋白,为多种疾病的早期诊断及合理治疗提供了有利的帮助。目前蛋白质组学用于甲状腺疾病研究主要集中在甲状腺肿瘤的特定生物标志物的探索,却很少有文献报道该方法用于HT差异性蛋白的研究。目的:本研究旨在应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,i TRAQ)蛋白质组学技术筛选HT中的差异性蛋白,并分析这些差异性蛋白在HT发生、发展中可能的作用机制。方法:收集2016.11月至2017.04月就诊于南京医科大学第一附属医院内分泌科门诊且确诊为HT患者(伴或不伴有结节),及甲状腺功能及抗体均正常的单纯结节患者。利用超声引导下甲状腺超细针穿刺术提取HT患者甲状腺组织(若伴有结节,穿刺甲状腺结节旁组织),及单纯结节患者的结节旁正常甲状腺组织,最终通过i TRAQ定量蛋白组学技术鉴定以及分析样品中差异性蛋白的表达水平。共收集48例符合标准的病例,其中HT患者24例,女性23例,男性1例,平均年龄(41.38±12.99)岁;单纯结节者24例,女性19例,男性5例,平均年龄(48.54±11.67)岁。应用i TRAQ定量蛋白质组学技术筛选差异蛋白,试验组与对照组共鉴定出911种蛋白,有161种表达蛋白具有统计学意义,其中55种蛋白在HT患者中表达上调,106种蛋白表达下调。利用GO及KEGG通路分析,这些差异蛋白参与了重要生物学功能,如细胞组成,信号转导及生物调节过程等。最终联合评估参与多种通路的差异性蛋白及这些蛋白参与的生物学功能,进一步筛选出热休克蛋白90β(Heat Shock Proteinβ,HSP90β),冠蛋白-1A(Coronin-1A),核内不均一核糖蛋白A2/B1(Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1,Hn RNPA2/B1),肠型碱性磷酸酶(Intestinal alkaline phosphatase,IAP),三元基序蛋白家族9(Tripartite motif9,TRIM9)和水通道蛋白1(aquaporin1,AQP1)6种显著差异性蛋白。结果:结论:通过i TRAQ定量蛋白组学技术发现与正常甲状腺组织相比,HT甲状腺组织中存在差异性蛋白。上调表达的差异蛋白可能与促进效应T细胞的异常活化或炎症因子表达增加,导致自身免疫炎症的发生或加重的通路相关;而下调表达的差异蛋白可能与炎症通路的抑制作用减弱相关。这些差异性蛋白可能在HT的发生、发展中发挥重要的作用。