核酸碱基分子间相互作用若干问题的量子化学研究

来源 :中国科学院化学研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lhawk
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光核酸酶诱发的核酸内电子转移与核酸的氧化损伤、修复过程的研究息息相关.这一过程主要涉及光核酸酶与核酸之间的识别,碱基之间的相互作用、核酸的碱基组成和碱基序列等等问题.众多的实验和理论研究围绕这些问题展开,但由于许多的结构不确定性和实验条件的差异,也出现了许多相悖的结论,理论研究也仅仅局限气相条件下的定性研究.然而,正如以前的研究,生物分子的构象与其功能表达和环境影响密不可分.由于目前的计算能力和效率还不能实现生物大分子的从头计算,我们使用了组合或杂化量子力学、分子力学方法 ,即QM/MM方法,研究了环境效应对溶质的影响.这里,主要使用了两种QM/MM方法:即组合量子力学、分子力学方法(IONIOM)和有效片段势方法(EFP).结合ab initio的计算结果,我们考虑了环境效应对核酸的结构、性质、以及核酸的氧化损伤性质的影响.
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