目前，我国立法上、实践中、社会上对乙肝病毒携带者存在歧视。歧视乙肝病毒携带者的原因在于立法上有漏洞、行政执法不力、司法救济不足、社会习惯偏见和经济利益驱使。 乙肝病毒携带者平等就业权是法定权利，是基本人权和宪法权利。但是，在转化为现实权利时存在缺失，现实权利才是人权的归宿。作者分析了乙肝病毒携带者平等就业权与其他主体权利的冲突及其原因，认为用人单位的用工自主权应尊重乙肝病毒携带者的劳动权利。乙肝病毒携带者在日常的工作中传染几率很低，其他公众可以通过注射疫苗的方法防止乙肝病毒传染。乙肝病毒携带者平等就业权与政府公共权力同样存在冲突，乙肝病毒携带者平等就业权应优先于政府公共权力。 作者建议应从立法、执法、司法三个方面对乙肝病毒携带者平等就业权加以保护。在立法上，应完善劳动立法，制定反就业歧视法。在执法上，卫生行政管理部门和劳动行政管理部门应严格对乙肝病毒携带者平等就业权的保障。卫生行政管理部门应纠正对乙肝病毒携带者的错误看法，在全国范围内接种疫苗。国务院劳动部应制定规章来规范用人单位对肝器官体检的要求。在司法救济上，应扩大劳动仲裁和行政诉讼的受案范围，违宪审查能从根本上解决乙肝病毒携带者的就业困境，但是不具有现实性。