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毛花猕猴桃（Actinidia eriantha Benth）因其良好的剥皮性能和极高的AsA（Ascorbic acid,亦称抗坏血酸、维生素C）含量而引发研究者对其的关注。本研究利用在江西省抚州市南城县麻姑山自然保护区境内前期观察定位的145份野生毛花猕猴桃种质资源,通过变异性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析的方法对其成熟果实主要内在品质指标进行分析与探讨,可以为毛花猕猴桃选育优异新品种提供材料基础和评价参考;利用SSR分子标记技术对供试野生毛花猕猴桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示其种质间的差异和亲缘关系及分子水平的遗传多样性,可为其种质资源可持续发展与利用奠定理论基础;在以上基础上,通过SSR关联分析检测野生毛花猕猴桃果实主要内质指标的自然变异与SSR标记之间的关联,可为野生毛花猕猴桃品质遗传改良、种质多样性研究、优异等位基因的发掘及种质资源利用提供参考。主要研究结果如下:（1）供试的145份野生毛花猕猴桃的7个主要内在品质指标都存在丰富的变异。按照其变异系数从大到小的顺序排列,依次为可溶性糖含量、类胡萝卜素含量、叶绿素含量、可滴定酸含量、AsA含量、干物质（Dry matter,DM）含量和可溶性固形物含量（Soluble solids content,SSC）,分别是39.19%、35.17%、34.30%、20.25%、19.48%、19.04%和18.70%,平均达到26.59%;同时,各指标对应的变幅依次为1.39%～12.87%、0.3～2.79mg.（100g）-1、1.15～10.26mg.g-1、0.78%～2.51%、3.53～9.40 mg.g-1、6.64%～23.08%和6%～17%;进一步通过相关性分析探讨了野生毛花猕猴桃7个内质指标之间的相关关系;主成分分析将原有的7个野生毛花猕猴桃内质指标转化为4个新的、综合而又相互独立的主成分,再通过4个主成分的贡献率及其相应的隶属函数值通过加权方法对所有样本进行了综合评分,筛选出16份优异的野生毛花猕猴桃种质。聚类分析在遗传距离为1.486时,将供试的145份野生毛花猕猴桃资源分为了Ⅵ个类群。（2）利用SSR分子标记对供试野生毛花猕猴桃种质资源进行遗传多样性分析,40对SSR引物在145份材料中共检测出224个等位基因,每对引物检测到的等位基因数变化范围为3～13个,平均每对引物检测到等位基因5.6个,平均有效等位基因数为2.83,Shannon’s信息指数为1.12,Nei’s基因多样性指数为0.566,期望杂合度为0.57,表观杂合度为0.54;UPGMA聚类分析在遗传距离为0.099处将145份野生毛花猕猴桃种质资源分成了13个类群。（3）利用40对覆盖全基因组的SSR分子标记对供试材料进行群体结构和连锁不平衡（LD）分析,在此基础上,利用Tassel 2.1软件中的一般线性模型（GLM）将SSR位点与野生毛花猕猴桃主要内质指标进行关联分析。群体结构分析将供试材料分为3个亚群;经过基因频率为0.05的条件过滤后,35对SSR多态性标记中部分存在显著的连锁不平衡;进一步关联分析发现,在P<0.05的情况下,检测到8个标记（UDK96-035、UDK96-039、UDK96-040、A193、FOR11、FOR22、ST-Acd07、UTH03-04）与5个品质性状相关联,分别是可溶性糖、可滴定酸、叶绿素、DM和SSC;在P<0.01的情况下,检测到引物A193与可溶性糖存在极显著相关关联。