二穗短柄草(Brachypodium distachyon)广泛分布在地中海和中东等地区，一年生，多为二倍体，基因组大小约为300 Mbp，与禾谷类作物亲缘关系密切，是一种理想的研究温带禾谷类植物的模式植物。作为新兴的模式植物，对于二穗短柄草遗传资源的研究，具有重要的意义。　　对源于以色列7个地区189个二穗短柄草生态型7个农艺性状进行多样性分析显示，在成都平原自然条件下，其发芽率和千粒重群体间方差分析呈极显著差异，其余5个性状在群体间和群体内差异均达极显著水平；5个性状的平均表型分化系数（VST）为57.00％，群体间的变异（39.41%）大于群体内变异（28.02%），说明群体间变异是二穗短柄草表型遗传变异的主要部分。斯皮尔曼秩相关分析表明，二穗短柄草的性状之间有4对显著正相关（p<0.05），各性状与生态地理因子有23对显著相关。群体间平均分类距离UPGMA聚类分析表明，12个二穗短柄草群体可划分为5组。农艺性状研究表明“进化谷”材料有着丰富的多样性。　　采用SDS-PAGE对其中182个生态型进行谷蛋白遗传多样性分析。对其中20条带进行多态信息含量（PIC）分析显示，仅50%的条带为中度多态性条带，其他为低度多态性条带。群体间遗传距离0.0322~0.3069，平均值为0.1442。群体 EC（即“进化谷”）的遗传多样性最丰富。遗传分化系数显示GST平均值为0.4847，表明以色列材料变异的大部分是由种群内部差异产生的。斯皮尔曼秩相关分析显示，二穗短柄草谷蛋白条带群体（除EC外）遗传指数He和I与环境变量平均炎热干燥天数（Sh）呈显著正相关（p<0.05），条带He值与生态地理因子有38对显著相关。聚类分析将182份材料分为2大类，来自Nahal Oren与Wadi Kelt地区的大部分材料聚为一类，其他材料聚为一类。主坐标分析与聚类分析所得结果基本一致。谷蛋白分析同样体现了“进化谷”材料丰富的多样性。　　综上，本研究对源自不同生态环境的二穗短柄草居群材料进行的遗传多态性分析，表明二穗短柄草具有丰富的遗传多样性，并呈现适应性分化的特征，为深入分析禾谷类植物重要农艺性状形成与功能基因组学研究的奠定了基础。“进化谷”可以作为短柄草微进化研究的模型。