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水稻(Oryza sativa L.)是最重要的粮食作物之一，具有较小的基因组(430Mb)，与其他禾本科植物的基因组具有良好的共线性，易于体外操作与分化，是研究单子叶植物基因组的模式植物。近年来水稻基因组研究取得了很大进展，构建了遗传图谱和物理图谱，完成了籼稻和粳稻的全基因组草图测序(Yu et al.,2002;Goff et al.,2002)，2002年12月18日国际水稻基因组测序计划工作组在东京宣布，国际水稻基因组测序计划已圆满完成，共测定碱基对366，000kb，精确度达到99.99％