为了调查中国绒山羊遗传资源现状,作者应用联合国粮农组织和国际家畜研究所推荐的19对微卫星引物并结合荧光PCR技术,对9个中国地方产绒山羊群体和1个西非山羊品种进行了遗传多样性检测;同时我们根据所测量的部分绒性状数据分析了这些绒性状指标与微卫星标记的相关性。另外,作者对与生产性状潜在相关或与免疫相关的9个基因序列进行了测序,根据测序结果从中选择了可以导致氨基酸改变的6个SNP对10个山羊群体进行基因分型,以考察它们是否受到自然或人工选择的作用。微卫星标记分析结果显示:14个微卫星座位在10个山羊群体中显示为高度多态,可作为山羊遗传多样性和群体间遗传关系分析的有效标记。多态信息含量和遗传杂合度等数据表明:目前中国地方产绒山羊群体的遗传多样性较为丰富,并且大部分保种场较好地保存了这些地方资源。采用非加权配对算术平均法构建的聚类图和采用主成分分析法得到的散点图均显示,中国山羊与西非山羊为不同的2类;中国产绒山羊中河谷山羊、河西绒山羊与其他山羊的遗传距离较远;其他山羊又大致分为2类:一类由辽宁绒山羊、新疆山羊、柴达木山羊、陕北山羊组成,另一类由内蒙古绒山羊组成。结构分析软件也基本支持这一结论。群体结构分析发现:大部分群体处于不平衡状态,且大多数群体均表现出极显著的杂合子缺失,暗示绒山羊的群体结构有所改变,群体内可能存在不同程度的近交。针对这种现状,育种者必须采取相应措施来增加保种群体的遗传基础,尽量不作有方向性的选择;对于一些被隔离的小种群,应扩大其分布区域,相互建立起一定的基因交流,改善现存的种群状况;另外应选取遗传多样性丰富的个体作为亲本进行扩繁和再引入。微卫星与绒性状的最小二乘方差分析结果显示:部分微卫星标记与部分羊毛性状相关显著。微卫星MCM527与绒的舒适度极显著相关,与绒毛长度显著相关;MAF70与绒的细度显著相关;SRCRSP5、BM1818与绒毛长度显著相关。推测山羊4号染色体上可能存在影响绒细度的QTL或基因;MAF70座位上等位基因140、154、156、158对绒细度性状起正面影响,可作为标记辅助选择的依据。经分析,6个被测SNPs均在Fst和杂合度构建的联合分布曲线的95%置信区间内,暗示它们可能并未受到自然或人工选择的作用。但这一分析方法为下一步批量基因的类似研究提供了一个思路。此研究为开展我国地方绒山羊种质特性研究及资源保护和利用提供了科学依据。