自备铁路车辆是用车企业为满足自身生产、经营需要而购置的铁路货车，过轨运输是指自备车经过轨站进入或通过国家铁路网所完成的运输过程。随着我国铁路运输企业的不断深化改革，铁路产业政企分离，再加上铁路货运组织改革的不断推进及铁路运输市场化，使得原有自备车管理模式越来越不适应现代铁路运输企业的发展，如何完善自备车过轨运输管理模式成为了当下一个亟待解决的问题。本论文在广泛分析国内外相关资料的基础上，以西安铁路局管内自备车为样本，以提高自备车过轨运输效率，实现自备车购置企业与铁路运输企业双方效益最大化为目标，对自备车过轨运输管理模式做基础研究和系统分析。首先，以原管理模式—基于原行政许可制度的分级管理模式及现有管理模式—基于协议制的统一管理模式为基础，总结分析了各管理模式的组织结构及存在的一些问题，并从管理机制、服务质量、运输效益三个角度对这两种管理模式进行比较分析。其次，结合现代化的物流系统管理理念、市场化的运输需求及资源输出区域自备车过轨运输需求特征，构建资源输出区域自备车集中化管理模式，该模式主要体现在分区域成立自备车物流公司（自备车运输代理机构），整合区域自备车运输资源，由物流公司对所属自备车进行标准化、专业化的集中管理，按照市场机制运行。最后，以提高服务质量为基本原则，对自备车过轨运输管理进行评价，并对评价结果进行分析，提出提高服务质量的改进措施。