地衣芽孢杆菌MY75几丁质酶特性及表达调控元件的研究

来源 :南开大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lmnlmnbalance
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
MY75菌株是本室保藏的一株革兰氏阳性、芽孢杆菌。当培养基中有几丁质存在时,该菌株能够大量表达胞外几丁质酶,且酶活力在筛选的近1000株芽孢杆菌中是最高的。为了明确MY75菌株的分类地位,首先对该菌株进行了鉴定。在鉴定过程中发现,MY75菌株16S RNA序列与枯草芽孢杆菌菌群(Bacillus subtilis group)中的芽孢杆菌之间具有高度的相似性,而不能利用目前广泛采用的16S RNA序列分析法进行有效地区别。于是,又以另两个蛋白编码基因gyrA(编码DNA促旋酶A亚基,gyrase subunit A)和rpoB(编码DNA介导的RNA聚合酶p亚基,RNA polymerase subunit beta)序列为依据,并参照Biolog微生物自动鉴定的结果,最终确定MY75菌株为地衣芽孢杆菌(Bacillus lichenifromis)MY75菌株在培养96小时后,产生的胞外几丁质酶达到顶峰—4.645 U/mL使用从该菌培养上清液中制备的粗蛋白进行了抑真菌实验,发现几丁质诱导后的菌株粗蛋白能够完全抑制小麦赤霉(Gibberella saubinetii)和黑曲霉(Aspergillus niger)孢子的萌发,而未经诱导的样品则没有此效果,初步证明MY75菌株培养上清液的抑真菌活性来源于其高量表达的胞外几丁质酶。将MY75菌株培养液上清中的粗蛋白进行初步分离纯化,经酶谱分析技术检测,发现一条特异的、约55 kDa大小的蛋白带表现出几丁质酶活性。对该蛋白进行飞行时间质谱(time-of-flight mass spectrometer, TOF MS)分析,发现其氨基酸序列与蛋白质数据库中的地衣芽孢杆菌67 kDa大小的几丁质酶同源性很高。根据GenBank中已提交的地衣芽孢杆菌几丁质酶序列设计引物扩增并克隆了MY75菌株中的几丁质酶基因chiMY75。该基因的开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)长度为1797 bp,编码599个氨基酸,预测蛋白大小为67 kDa。该ORF序列与GenBank中已有的地衣芽孢杆菌几丁质酶基因序列的相似性达99%。将chiMY75亚克隆至表达载体pET28a并转化E. coli。在转化子细胞的破碎上清液中检测到了特异表达的67 kDa大小的蛋白。对异源表达的几丁质酶ChiMY75的特性进行了研究。该酶的最佳作用pH值为7.0,最佳作用温度为50℃。锰、铬、锌、银四种离子能够显著地降低ChiMY75的活性;而锂、钠、镁离子则对酶活力有轻微的促进作用;铜和铁两种离子则会使该蛋白完全失去活性。在抑真菌活性检测中,酶活力为6.32 U/mL的ChiMY75能够完全抑制小麦赤霉和黑曲霉的孢子萌发。在杀虫生物测定中,ChiMY75的加入使得苏云金芽孢杆菌对甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)幼虫的毒力提高了27%。为了对芽孢杆菌几丁质酶的调控元件进行研究,克隆了MY75菌株几丁质酶基因完整序列chiMY75full,包括ORF及其上游调节区域的432 bp。同时将本室前期克隆的苏云金芽孢杆菌15A3菌株的几丁质酶完整基因chiB也作为研究对象。利用软件对上述两个几丁质酶基因的上游调节序列进行了分析,预测出潜在的启动子序列等调控元件。序列分析发现,二者的上游序列中均存在长度为16 bp的正向重复序列。两个完整的基因都可以利用自身携带的启动子在E. coli中大量表达几丁质酶。对所发现的重复序列分别进行了定点的部分及全部缺失,从酶活性、蛋白表达量以及特异mRNA转录量三个水平观察缺失基因调控表达的变化。酶活检测结果证明,缺失chi基因正向重复序列的转化子培养液的酶活力明显高于完整chi基因的转化子;蛋白质SDS-PAGE电泳结果显示,缺失正向重复序列的一系列chi基因所表达的几丁质酶蛋白量显著高于完整的chi基因的转化子;Northern Blot结果显示,缺失重复序列之后,与两种几丁质酶基因相对应的mRNA转录量也有显著提高。这些结果证明,芽孢杆菌几丁质酶基因中的正向重复序列,是基因表达时的负控制调节元件,很有可能是转录抑制物的结合位点。定点缺失结果还显示,缺失全部重复序列的chiB基因与缺失部分重复序列的chiB基因相比较,三个检测水平都明显增高。本研究中,我们将MY75菌株鉴定为地衣芽孢杆菌。通过在E. coli中的异源表达,确定了MY75菌株中几丁质酶的抑真菌活性及对苏云金芽孢杆菌杀虫的增效作用。在2株芽孢杆菌几丁质酶编码基因的上游,均发现了正向重复序列,通过对正向重复序列的定点缺失,证明该序列是几丁质酶基因表达的负调控元件,能在转录水平上控制几丁质酶的表达。本研究不但为芽孢杆菌几丁质酶基因调控机理的研究提供了基础,还证明了MY75菌株在生物防治方面的应用潜力
其他文献
在十二届全国人大五次会议上,李克强总理作的《政府工作报告》里除"人工智能"、"海绵城市"等词已被大家熟知外,还有不少较为陌生的词汇。有鉴于此,笔者特从《政府工作报告》整理
主要介绍利用RTK进行地形测量的主要流程,分析了RTK测量精度,并提出了提高RTK测量精度的对策。利用RTK进行地形测量,明显提高效率,节省大量的人力物力,满足精度要求。
随着我国经济快速发展,大众的生活质量明显提高,大众对于医疗卫生服务的要求也随之升高。因此我国的民营医疗机构也在不断增加,越来越多的民营医疗机构在居民的日常生活中发挥自身作用,与此同时,关于民营医疗机构的监管要求也日益凸显。西安市莲湖区民营医疗机构近年的发展速度很快,目前区内已经有包括门诊部、诊所、医务室等不同类型的民营医疗机构近百家,在提供越来约多的公共医疗服务的同时,也出现了不少问题,莲湖区对民
金王朝以武立国,其国运兴衰与战争密切相关。军队作为国家安全的重要保障,其后勤补给如何不仅决定着战争的胜负,甚至还与国家的命运休戚相关。金朝军队的后勤补给系统初创于
本文通过描述阿美石油项目的抹灰施工工艺、结合多年的施工经验总结对抹灰施工过程应注意的质量、安全环保、技术要点、常见问题、质量通病、产生原因以及预防措施的进行简要
随着经济全球化的快速发展和市场的激烈竞争,很多中小企业为实现健康持续发展实现企业战略目标,都在不断的探索方法加强企业核心竞争力。可很多企业家发现公司的战略目标并不
目的 了解专科护生实习前后职业认同现状并比较差异.方法 采用护生职业认同问卷对在3所二级甲等医院临床实习的215名专科护生进行问卷调查.结果 实习前后专科护生的职业认同
随着工业化与城市化快速发展,生态文明越来越受到重视,而水生态文明是生态文明的基础和支撑,推动了我国生态文明的建设。国务院于2012年特别印发《关于实行最严格水资源管理
目的了解醛固酮合成酶(CYP111B2)基因启动子区域-344T/C位点多态性与深圳地区原发性高血压人群之间的相关性,为本区EH的诊断、治疗及预防提供科学依据。方法收集2017年3月~201
[目的]探讨经皮椎弓根内固定联合椎体后凸成形术在治疗胸腰椎骨质疏松性压缩骨折中的应用。[方法]2014年12月~2016年5月在本院就诊的骨质疏松性胸腰椎骨折患者106例,随机分为