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云南金钱槭（Dipteronia dyerana Henry）隶属于槭树科（Aceraceae）金钱槭属（Dipteronia）,为中国特有种,仅局限分布于云南文山、屏边和蒙自交界的老君山地区,已被列为国家二级濒危保护植物。近年来,有关部门已经对其实施了迁地保护和就地保护措施。本研究利用ISSR分子标记技术,对云南金钱槭现存的5个自然居群和1个迁地居群的遗传多样性和遗传结构进行了研究,得到以下结论: 用10个ISSR引物对云南金钱槭5个自然居群（WZ、WM、WC、MZ和PB）和1个迁地居群（KM）的93个个体进行了PCR扩增,共得到154个清晰的扩增条带。5个自然居群的平均多态位点百分率（PPF）为28.57%,平均基因多样度(HPOP)为0.0898,居群平均遗传多样性水平较低。其中PB居群的多样性水平最高,HPOP值达0.1366。AMOVA结果表明,总的遗传变异中,居群内遗传变异占60.46%,居群间占39.54%;根据POPGENE软件计算出的遗传分化系数GST为0.375。结果表明,云南金钱槭居群间的遗传分化较大。聚类分析（UPGMA）和主成分分析（PCA）的结果均显示MZ居群与其他居群分化十分明显。Mantel检验揭示了遗传距离和地理距离之间存在显著相关性（r=0.782,P=0.021）。基于本研究的遗传学数据,并结合物种的演化历史和地质学资料,推测云南金钱槭居群历史上曾经历了严重的瓶颈效应,有限的基因流和一定程度的遗传漂变是造成云南金钱槭遗传多样性水平低,居群间遗传分化高的主要原因。 本研究通过自然居群、迁地保护居群、自然保护区内的就地保护居群的遗传多样性和等位基因频率分布情况的比较,对迁地保护和就地保护的有效性进行了评价。研究结果表明,自然保护区内的居群（WZ、WM、WC）的多样性水平(Hpop=0.0769)低于保护区外的居群（MZ和PB）（Hpop=0.1091）;迁地居群（KM）的多样性水平(Hpop=0.0791)低于自然居群（WZ、WM、WC、MZ和PB）(Hpop=0.0898)。迁地保护和就地保护都没有将多样性最高的PB居群保护在内。自然保护区内居群包含物种全部遗传变异的79.87%,迁地保护居群拥有物种70.13%的总遗传变异。若考虑中等频率到高频率的等位基因,现有的自然保护区仅保存了该物种的59.63%的变异,迁地保护区仅保存了该物种的87.07%的变异。由此可见,就地保护和就地保护都没有保存足够的遗传变异。特异性条带的分布统计