改革开放以来,伴随着中国经济所创造的“世界奇迹”,农业经济也获得了举世瞩目的成就。但农业的成功并非没有代价,农业因为大量使用农药、化肥、农膜等化学工业品而产生了严重的环境污染问题。农业的长期可持续发展必须转变到依赖于全要素生产率提高的道路上。本文以重庆市为例,采用农作物总播种面积、乡村从业人员、农用化肥施用折纯量、农用机械总动力四个投入指标,农林牧渔业总产值作为产出指标,对重庆市2000年到2014年的农业全要素生产率整体演变情况进行分析,并对所有区县2004年至2014年的农业全要素生产率进行测算、比较,并分析其区域差异。最后从需求条件、产业结构、财政支出比重、对外开放水平、市场化水平等多个角度对重庆市农业全要素生产率增长影响因素进行探讨。研究结果表明:(1)重庆市农业总产值绝对额不断增加,但增长的速度处于缓慢下降趋势;农业产业贡献率和拉动力不断下降;农用机械总动力、农用化肥施用量、农膜使用量三个投入要素都出现了稳步上升态势;从农药使用量来看,总体也呈现出先上升后下降走势。(2)2000年至2014年,重庆市农业全要素生产率整体波动较大,农业全要素生产率年均增长幅度为2.38%。从各区县的比较来看,各区县增长差异较大,最高的为大足区,年均增长率为17.59%,最低的是璧山区,年均增长率仅为5.84%。三大区域农业全要素生产率波动趋势大体是一致的,“一小时经济圈”所属区县年均增长幅度最大为10.56%,其次为渝东北翼,为10.03%,最小的是渝东南翼为8.90%。(3)人均纯收入、第二产业占国内生产总值比重、政府财政支出比重、农林水支出占财政支出比重、商业化率5个变量均对农业全要素生产率的变动产生了显著的正向影响。人均消费支出变量则对农业全要素生产率的变动产生了显著的负向影响。本文针对重庆市农业经济发展中的全要素生产率进行研究,研究结果有利于正确认识其农业经济发展模式,也有利于正确评估重庆市农业经济增长状况,从而制定合理的政策推动重庆市农业现代化进程健康、持续发展。