若尔盖湿地位于四川省阿坝藏族自治州的若尔盖县,在青藏高原湿地生物多样性保护中占有重要地位,而真菌多样性作为若尔盖湿地物种多样性的重要组成部分,具有很大的研究价值。本研究共采集了若尔盖湿地100个土样的土壤,用稀释平板法和Miseq高通量测序两种方法研究了若尔盖湿地土壤真菌的多样性和生态位。用稀释平板法测定100份土样的结果表明,若尔盖湿地土壤真菌的数量平均为237.86±49.68 (1.05～3705.4) cfu.g-1。4种土壤类型的真菌数量表现为亚高山草甸土(446.27±195.92cfu.g-1)>草甸土(304.84±206.20cfu.g-1)>风沙土(136.09±49.05cfu.g-1)>泥炭土(132.95±50.57cfu.g-1)。共分离得到593株真菌,在已鉴定的337株真菌中包括子囊菌门、接合菌门和担子菌门,其中子囊菌门249株,占73.88%,包含青霉(Penicillium spp.)、木霉(Trichoderma spp.)、曲霉(Aspergillus spp.)、镰刀菌(Fusarium sp.)、链格孢(Alternaria sp.)、轮枝孢(Vertieillum sp.)、茎点霉(phoma spp.)、拟盘多毛孢(Pestalotiopsis sp.)、短梗霉(Trichocladium sp.)、毛壳菌(Chaetomium spp.)、漆斑菌(Myrothecium sp.)、枝孢菌(Cladosporium sp.)、蛹虫草菌(Cordyceps sp.)、黑附球菌(Epicoccum sp.)、小双胞腔菌(Didymella sp.)、 Paraphaeosphaeria spp.、树粉孢(Oidiodendron sp.)、赤壳霉(Nectria sp.)、短梗蠕孢(Trichocladium spp.)、毕赤酵母(Meyerozyma spp.)、被孢霉(Mortierella spp.)。接合菌门85株,占25.22%,包含毛霉(Mucor spp.)、根霉(Rhizopus sp.)、高山被孢霉(Mortierella. alpina sp.)、雅致放射毛霉(Actinomucor sp.)、接霉(Zygorhynchus sp.)。担子菌门3株,占0.89%,包含裂褶菌(Schizophyllum sp.)。在风沙土中M. hiemalis为优势类群,相对丰度为50.11%；在若尔盖湿地土壤真菌中,分离频率排在前5位的是：Mucor hiemalis、Penicillium subrubescens、Penicillium sp.、Cladosporium sphaerospermum、Trichoderma harzianum。在草甸土中Penicillium dipodomyicola和Penicillium subrubescens为优势类群,相对丰度分别为34.43%和11.56%；在亚高山草甸土中P. subrubescens和Penicillium sp为优势类群,相对丰度分别为20.43%和18.14%；在泥炭土中Cladosporium sphaerospermum和Trichodermaharzianum为优势类群,相对丰度分别为20.99%和20.22%。若尔盖湿地真菌多样性指数平均为1.03±0.06(0～2.75),丰富度指数平均为5.82±0.40(1-24),均匀度指数平均为0.63±0.02(0.06-1)。4种土壤的多样性指数表现为风沙土(1.24±0.24)>亚高山草甸土(1.02±0.12)>草甸土(0.89±0.12)>泥炭土(0.65±0.18)。4种土壤类型的丰富度指数表现为风沙土(9±1.69)>亚高山草甸土(5.31±0.53)>草甸土(4.5±0.47)>泥炭土(3.2±0.61)。4种土壤类型的均匀度指数表现为泥炭土(0.69±0.11)>亚高山草甸土(0.61±0.05)>草甸土(0.59±0.05)>风沙土(0.58±0.09)在土壤类型因子上Penicillium subrubescens、Mucor hiemalis、Trichoderma harzianum的生态位较宽,在土壤深度因子上Penicillium skrjabinii、Penicillium subrubescens、Penicillium、Penicillium dipodomyicola、Fusarium sp.、Cladosporium sphaerospermum、Actinomucor elegans、Mucor hiemalis、Mortierella alpina、 Trichoderma saturnisporum的生态位较宽。对包含4种不同土壤类型的11个样点进行高通量测序,平均每个样点获得的Reads数为412765±5337。所检测到的真菌包括接合菌门、子囊菌门、壶菌门、担子菌门、球囊菌门、芽枝霉门共701个种,385个属。其中芽枝霉门仅在亚高山草甸土中存在。在种的分类水平上,在草甸土中检测到的种有42种,在风沙土中检测到的种有59种,在亚高山草甸土中检测到的种有139种,在泥炭土中检测到的种有64种。PCoA (Principal Co-ordinates Analysis)结果显示不同土壤类型的样点相互之间都有交集。若尔盖湿地土壤真菌多样性指数平均为7.76±0.31(6.11-9.3),OTU丰富度平均为3569±341.81(1536～5324)。4种不同土壤类型的多样性指数表现为泥炭土(8.80±0.50)>亚高山草甸土(8.34±0.23)>草甸土(7.19±0.71)>风沙土(7.05±0.48)。4种不同土壤类型OTU的丰富度表现为泥炭土(4063.50±9.50)>草甸土(3789.67±516.18)>亚高山草甸土(3530±1017.25)>风沙土(3057.67)。在土壤类型因子上,生态位较宽的有Penicillum、Fusarium、 Aspergillus、Cladosporium、Phoma、Mortierella、Chaetomium、Coryespora、Preussia、 Cryptococcus、Glomus,说明其对资源的偏好较小,对土壤类型的适应范围较广。对比稀释平板法和高通量测序的结果表明,高通量测序在信息量上远远大于传统的土壤真菌分离方法,显示的真菌多样性远高于稀释平板法。在高通量测序中相对丰富度排在前20的属中有13个属用传统的分离方法并未分离到,但也有像木霉等常见土壤真菌,在高通量测序中未被测出。在对生态位的计算方面,对比传统的分离培养法和高通量测序,发现青霉、镰刀菌、曲霉、枝孢菌、链格孢属、高山被孢霉的高通量测序方法计算得出的生态位要明显偏高。总之,高通量测序技术是一种更准确更快捷的研究土壤微生物生态的方法。