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【目的】分析系统性红斑狼疮（SLE）合并动脉粥样硬化(AS)模型鼠全基因组DNA甲基化水平及雌激素受体α（ERα）基因启动子甲基化状态，探讨其在SLE并AS发病机制中的作用。【方法】将11只apoE-/-C57BL/6小鼠随机分为造模组（A组）、对照组（B组）；11只普通C57BL/6小鼠亦随机分为造模组（C组）、对照组（D组）。模型组一次性腹腔注射降植烷0.5ml，对照组一次性腹腔注射生理盐水0.5ml；8个月后处死小鼠，提取基因组DNA，检测其全基因组DNA总甲基化水平，并采用甲基化特异的焦磷酸测序法分析雌激素受体α基因启动子甲基化状态，比较各组间的差异。采用SPSS17.0进行统计学分析，4组间两两比较用单因素方差分析，方差齐时使用LSD-t检验，方差不齐时采用Tamhane’s T2检验。【结果】1.全基因组DNA甲基化水平分析A组、B组、C组、D组基因组DNA总甲基化率分别为（4.7±1.5）%、（5.1±0.5）%、（6.6±1.6）%、（7.5±1.6）%。与D组对比，A组、C组全基因组DNA总甲基化水平明显下降（P＜0.05）；与B组对比,A组全基因组DNA总甲基化水平明显下降（P＜0.05）；而B组与D组对比差异无统计学意义（P＞0.05）。2.雌激素受体α基因启动子甲基化状态2.1雌激素受体α基因启动子区平均甲基化率分析结果A组、B组、C组、D组ERα基因启动子区平均甲基化率分别为（13.0±3.1）%、（26.7±7.2）%、（15.7±3.8）%、（21.4±4.2）%。A组、C组与D组对比ERα基因启动子区平均甲基化水平明显下降（P＜0.05）；A组与B组对比ERα基因启动子区平均甲基化水平明显下降（P＜0.05）；而B组与D组对比升高，但差异无统计学意义（P＞0.05）。2.2雌激素受体α基因启动子区各个CpG位点甲基化率情况与D组对比，A组、C组的ERα基因启动子区中7个CpG位点甲基化水平均降低，其中各有3个CpG位点差异具有统计学意义（P＜0.05）；而B组的7个CpG位点甲基化水平均为升高，其中有4个CpG位点差异具有统计学意义（P＜0.05）。与B组对比，A组7个CpG位点甲基化水平均明显下降（P＜0.05）。【结论】降植烷诱导ApoE-/-C57BL/6小鼠狼疮样病变并动脉粥样硬化模型全基因组DNA甲基化水平降低，其雌激素受体α基因启动子呈低甲基化状态，表观遗传学在SLE并AS发病机制可能具有重要作用。