我国传统的药品流通体制存在诸多的弊病和不足，同市场经济体制严重不相适应，流通环节严重不合理，存在层次过多，销售渠道过长的弊病，药品从药品生产企业，到最终的消费者，要经过五道流通环节甚至更多，而每个层次的流通环节上的商业企业都需要依靠利润来生存，这就不可避免的导致了药品价格层层上升，而各个企业为了生存，采取各种手段来促进药品销售，这就使得一些暗箱操作愈演愈烈，回扣之风盛行。　　药品集中招标采购，是国务院确定的城镇医疗体制改革的重要内容，又是规范药品购销行为，从源头上遏制医药购销活动中不正之风、净化药品市场、保证药品质量的治本措施;是在应对WTO背景下，改变我国药品流通领域混乱状态，提高我国药品流通行业竞争性，降低药品流通费用，从而降低药品虚高价格，切实减轻群众不合理的医药费用负担，利国、利民的重要举措。　　在药品集中招标中全面利用电子商务技术，可以实现药品信息规范有序的采集、加工、发布、传递和应用，实现招标、投标、开标、评标及交易过程的电子化、网络化运作。使信息处理迅速，公开透明，有效地避免了人为因素的干扰，体现了招投标全过程的公开、公正、公平。对缩短集中招标采购的周期、降低采购成本，保证集中招标采购目标的实现，起到重要保证作用。医药电子商务，既是大势所趋，也是社会发展的必然。　　我国从1996年开始进行药品采购集中招标电子商务系统的探索，经过几年的努力，已经出现了以海虹医药电子商务有限公司为代表的电子商务交易中介代理机构。通过海虹电子商务平台交易的药品已占据国内药品交易额的10％，该公司在全国29个省市设立了电子商务公司，并成立了27个交易中心。在2002年实施了150个药品集中采购，交易额达122亿元。目前，海虹医药电子商务成为政府卫生、药监部门集中招标采购指定的代理机构。开辟了我国电子商务在医药的成功应用的先河。　　电子交易市场是电子商务应用的一个重要领域，也被看作是电子商务的高级阶段和发展方向，而在诸多电子交易市场中，尤为活跃的是B2B电子交易市场，即企业间电子交易市场。B2B电子交易市场具有很强的流动性，发展十分迅速，被认为是未来电子交易市场的主流。国外电子市场是一个研究热点，许多大学如密歇根和MIT建立了专门研究机构;企业如HP和IBM等也建立起电子市场实验室。目前，国外的研究着重于总结经验和解释现象，从企业角度和市场角度分析其对企业和市场的影响，或从应用角度在理论上的研究设计计算机系统实现其部分功能，在理论和实践方面都有待于深入和完善。　　独立第三方电子交易市场作为B2B电子交易市场发展的最高形式，具有很强的流动性，并且能够提供公开、公平、公正的企业间交易和行业信息服务，极大的减少了企业交易费用，成为未来行业理想的交易规制结构;同时，第三方电子交易市场的建设成本非常低廉，以无所不在的Internet作为它的交易工具，即使是实力不够雄厚的企业也能够顺利参与交易，从而不需要走西方企业信息化所走的老路，具有很强的后发优势。我国医药行业的现状，最大的特点就是药品生产商的数量多、规模小，缺乏竞争力，长期以来形成了医院的强买方市场，这种现状直接导致了医药采购过程中的种种弊病，交易费用居高不下。通过引入独立第三方电子交易市场，增强信息的流动性，可以实现准确、及时、公开的医药信息发布，对行业的发展进行有利的指引;同时，通过独立的第三方规制，可以减少医药采购过程中的繁多层级，从源头上遏制了医药行业的各种弊病，造福老百姓，促进我国医药行业健康的发展。另外，医药行业本身固有的特点，例如，药品体积小、标准统一等，也是非常适合推行第三方电子交易模式的。因此，独立第三方电子交易市场将会是我国医药行业电子商务的最佳模式选择。　　本文作为中国医药行业电子商务目标模式研究六个部分之一，主要内容是介绍电子商务的一般理论及电子商务应用的发展，从而从理论上论证中国医药行业采用独立第三方系统的电子商务模式的必要性和可行性，为我国医药体制改革提供一定的理论根据。本文分为5章，在第1章绪论中，文章着重阐述课题研究的背景，即我国医药行业的现状，以及国内外医药电子商务的发展状况，和本文的结构;文章从第2章阐述电子商务的概念、种类，以及作为B2B电子商务的一种模式的第三方独立系统的概念，并且通过科斯的交易费用学说和威廉姆森的交易规制结构学说来分析独立第三方系统的经济学必然性，指出独立第三方系统是电子商务以后的发展方向，最后归纳独立第三方系统电子商务模式的优点所在;第3章主要介绍作为一般电子商务的分支——医药电子商务的概念，以及医药电子商务在国外的发展历程，独立第三方系统在国外医药行业中的应用，同时分析国外医药电子商务模式对我国医药行业的借鉴意义;第4章，是针对我国医药行业的特殊性，将我国的医药行业与发达国家医药行业作一个简单的比较，并且罗列出了关于中国医药行业电子商务发展的几种不同观点，在整理和分析各种观点的基础上，进一步阐述在我国医药行业电子商务模式选择，即独立第三方系统电子商务模式;最后一章，作为独立第三方系统的应用案例，着重介绍目前在国内进行的比较成功的医药行业电子商务模式——海虹模式。