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2001年香港大学从香港入港口及鸟园市场的宠物鸟分离得到20株病毒，命名为A／Songbird／Hong Kong，SBxx／2001。其中大多数流感病毒来自鸟的饮用水。流感病毒分离率为5.6％(18／321)，而新城疫的分离率为0.6％(2／321)。大多数流感病毒来自passerineformes(雀科鸟)，少数来自psittocine species(鹦鹉鸟类)。 本文对H3N8亚型23株宠物鸟流感病毒分离株进行了部分及全基因序列测定，分析和分子演化的研究。首先将试验用的毒株在SPF鸡胚接种增殖，提取RNA，RT-PCR扩增，及应用特异引物进行测序，然后用DNASTAR(4.0 edition)和Tree View(1.6.6)软件进行序列和数据编辑，序列翻译，进化树绘制和分析。 进化树分析表明来自不同国家和地区的H3N8流感病毒的每一个基因都非常相似，都形成一个独立的分支，同源率为95.9-100％。特别要强调的是香港2001年的宠物鸟的毒株之间的同源率更高，达到99.2-100％。除了NA基因外，八个基因中七个基因都属于欧亚亚系。NA基因属于北美亚系不属于欧亚亚系，与A／Mallard／Edmont／220／90(H3N8)[MLEDM90](北美亚系)和A／Duck／Hokkaido／8／80(H3N8)[DKHOK80](欧亚亚系)同源率分别为92.8-94.2％和75.9-76.4％。H A基因与A／Aquatic Bird／Hong Kong／399／99(H3N8)[ABHK99]和A／Equine／Jilin／89(H3N8)[EQJL89]的同源性为最高，分别为93.0-94.1％和92.9-93.6％。与其它H3N8流感病毒不同，A／Parakeet／Netherland／33／01的HA基因在97-99位点上有一个额外潜在的糖基化位点NKT。98位点是受体结合为点，该位点的糖基化NKT可影响抗原的空间构型，干扰抗体与病毒的结合；同时也影响病毒与红细胞识别与结合，进而影响了HI的结果。A／Shama／CA(Indonesia)／99病毒的HA基因在抗原位点B191上的G氨基酸不同于其它病毒191位点上的D氨基酸。 所有的宠物鸟H3N8流感病毒NS基因都属于A亚群，同源率为97.8—99.9％。而“A／Duck/New Jersey／30746-5／00(H3N8)[DKNJ00]则属于“B allele”群；A亚群病毒包括人，猪和部份禽流感病毒，而B亚群中只包含禽流感病毒。A亚群与B亚群之间的同源率只有75％。同一亚群之间的同源率大于90％。只有同一亚群的病毒之间才有可能互相重组。张云摘要中国农业科学院博士学位论文 NP荃因与川Aq华‘cB加山Hong Kong/in603/98扭1 INI)【ABHK981同源率为9 5.6一9 7.9%.M基因与A江加c留HongKOn创698/79(H5N3)的同源率为97.00/0 .MZ基因的进化速度大于MI基因。以基因与A江加ck八诬ongKo明IY439197(H 9N2)的同源性为%.9%。PBZ基因与A佗nvironme助倪ong Kong/437一夕卯似5)同源率为95.5%.PBI基因与九。uck/Anyang/ AvL一l/01似SNI)的同源率为96.踢. 由核昔酸推理得到的氨基酸序列分析表明NP，淞，PBZ和PBI基因的某些位点的特异性氨墓酸与宿主类型有关.人和猪的淞基因包含的保守性氨基酸为工11，E14，G16，N20和H57，而禽类为Tll，G14，E16，520和Y57。正如九啊。ng Kong/156/97病毒一样，宠物鸟流感病毒H3NS含有类似人和禽特异性氨基酸E14和G 16。 所有流感病毒NP基因在450位点的氨基酸都是保守的，北美的流感病毒是450N，而欧亚亚系的流感病毒为4505，包括宠物鸟H3NS流感病毒。该位点氨基酸与病毒地域相关性可能是流感病毒长期进化的结果。 PA基因只有一个宿主特异性氨基酸在67位:人的流感病毒是67Gin，而猪和禽流感病毒为Arg，马流感病毒为67Lys。 PBZ基因有多个宿主特异性氨基酸:人的流感病毒分别为64T，81M，1995，475M，588V，627K和647T:而猪，马，禽的流感病毒是64M， 81T，199A，475L，588A，627E和647A。 PBI基因没有宿主特异性氨基酸。这与PBI基因负责RNA链的延伸功能有关，这一功能的广泛性使得PBI蛋白可以完成其功能而不受约束。 然而，宿主特异性是由多个基因决定的，不能片面强调某一个基因.尤其是队和NA的作用更不容忽视。同时还要考虑病毒在宿主中的适应性及病毒的进化趋势. 血凝抑制实验分析表明18株来自香港的宠物鸟的毒株抗原性极其相似，没有检侧到抗原差异。但是来自加拿大和川。伍川加，sLab的毒株刀ShamalCA伽山毗ia)月9和户JP断ak。吐加db盯land 133/01与来自香港2001年分离株的抗原性反应模式有所不同，与香港2 0 01年的病毒相比有8个低度降低。除了A/Par司沈e汀NetherlanLdl33101外，所有宠物鸟H3NS流感病毒都与H3亚型A/Nanc址m创13/oo人的流感病毒的抗血清反应.需要强调的是大部分的香港2 0 01年的病毒的抗原性都与扣晒抖汕刃正可89极为相似. 动物的复制实验表明香港宠物鸟流感病毒H3NS可以在鸡和鹤鹑的气管内大t复制，在感染后的第三天，分别在鸡和鹤鹑的气管内检测到1.8一4.510910/ml和3.5一5.010910/ml的病毒.第五天检测到的病毒t少于感染后的第三天.相反在鹤转张云摘要中国农业科学院博士学位论文的肠道内并没有检测到病毒:只有两只试验鸡在感染后的第五天的肠道内检测到少t病毒(0.于1 .510910/m1)。动物在感染期间没有任何疾病症状，体重增加。在感染后的第三天和第五天，都可在实验动物的饮水中检测?