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彩色马铃薯(Colored Potato)是块茎薯肉为紫色、红色、黑色等色彩的马铃薯,与薯肉为白色、黄色的普通马铃薯相比,因其富含天然抗氧化物质花青素,对人体具有更重要的生理保健作用。为了构建彩色马铃薯高密度分子遗传连锁图谱和定位花青素含量及产量等重要性状的QTL,对其分子标记辅助育种、重要性状基因图位克隆及精细定位研究等奠定基础,采用国内育成的彩色马铃薯品种‘黑美人’作母本(2n=4x=48),国外引进的彩色马铃薯品种‘MIN-021’(2n=4x=48)作父本,经人工去雄杂交和温室精心培育得到了杂种F1代分离单株无性株系210个。本研究以这些无性株系和其亲本为作图群体,利用SSR和AFLP两种分子标记及TetraploidMap for Windows作图软件,对彩色马铃薯遗传连锁图谱进行了构建,并在已构建出的高密度(标记间平均图距<5cM)遗传图谱上,对花青素含量、单株产量及商品薯率3个重要性状进行了QTL位点分析。主要结果如下:1.试验筛选出SSR和AFLP的适宜引物各34对和52对。利用这些引物对彩色马铃薯F1群体的210个分离单株无性株系及其亲本的基因组DNA进行PCR扩增,共得到980个多态性位点标记,其中SSR标记201个、AFLP标记779个。2.对980个多态性分子标记依据其亲本来源进行分类,有母本型标记419个,父本型标记385个,双亲型标记176个;在P<0.05水平下,偏分离统计分析结果为,母本‘黑美人’的595个标记中含偏分离标记为141个,占23.70%;父本‘MIN-021’的561个标记中含偏分离标记位122个,占21.74%。双亲均符合一般作物遗传作图偏分离标记比例<30%的要求。3.构建了彩色马铃薯亲本的高密度分子连锁图谱。母本‘黑美人’12个连锁群的总长为2469cM,标记间平均图距4.15 cM,含595个分子标记,其中SSR标记129个、AFLP标记466个;父本‘MIN-021’12个连锁群的总长为2692cM,标记间平均图距4.80cM,含561个分子标记,其中SSR标记131个、AFLP标记430个。4.彩色马铃薯薯块花青素含量、单株产量及商品薯率测量值均呈正态分布,这3个主要性状测量值用于QTL定位分析是可靠的。5.在双亲的遗传图谱上定位出薯块花青素含量、单株产量和商品薯率的QTLs共24个。在母本‘黑美人’的图谱上检测到13个QTLs,花青素含量有5个、单株产量和商品薯率各有4个,其遗传贡献率变幅为7.98%~19.62%;在父本‘MIN-021’的图谱上检测到11个QTLs,花青素和单株产量各有4个、商品薯率有3个,遗传贡献率介于8.70%~21.62%之间。