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杉木是我国特有的针叶速生用材树种，材性的遗传改良是其主要育种目标之一，育种者以杉木木材密度、色泽等性状改良为目标开展了大量的常规育种工作。近年，涉及木材性状形成的分子机制等相关研究已成为热点。本研究以杉木为材料，利用Illumina平台进行了转录组测序，获得了40217146个双端测序reads，生成了3.62Gb的原始数据以转录组测序获得的相关数据为基础，并进行组装，得到83248条Unigenes，平均长度为449bp。在注释的杉木Unigenes中，有14877条Unigenes在COG功能分类体系中具有具体的蛋白功能定义，而在GO功能分类体系中，有41902条Unigenes具有具体功能定义。通过Unigene数据库，大多数参与纤维素和木质素生物合成基因得到注释。在转录组测序的基础上，15个ClMYB基因的cDNA序列被成功分离。它们皆具有完整的ORF，且编码MYB蛋白都包含R2R3MYB结构域，与松科植物白云杉R2R3-MYB蛋白的DBD结构域序列一致性高达96%。对15个ClMYB基因的RT-PCR分析表明，它们在6个不同的器官中都有表达，ClMYB1、ClMYB3和ClMYB6在针叶中的表达量最高；ClMYB2、 ClMYB13和ClMYB14在根中的表达量最高；ClMYB5和ClMYB12在雌球花中的表达量最高，而ClMYB15在雄球花中的表达量最高，ClMYB11在根和雌球花中的表达量相同且都很高；而在ClMYB1和ClMYB2茎的表达结果中，且木质化茎的表达量都明显高于未木质化的茎。在对ClMYB1和ClMYB2进一步的定量PCR研究中发现了同样的规律，ClMYB1和ClMYB2都主要在木质部中表达，且两年生木质部中的表达量都高于一年生木质部中的表达量。经IAA、GA3和BR激素处理12小时后，ClMYB1和ClMYB2在木质部中的表达模式相似，均受到了诱导。在杉木应压木的诱导形成中，ClMYB1在处理第10天时，应压区的表达量是对应区的1.44倍；ClMYB2在应压区木质部中表现为下调表达。在ClMYB1和ClMYB2与13个杉木木质素合成相关酶基因的协同表达分析中，ClMYB1与ClC4H、ClCOMT、ClPAL3呈极显著正相关，ClC3H、ClCCoAOMT2之间呈显著相关，与ClPAL2显著负相关；ClMYB2与ClCAD1呈极显著正相关，与ClPAL2呈极显著负相关，与ClCCoAOMT2呈显著正相关，与Cl4CL呈显著负相关。这些结果显示，ClMYB1、 ClMYB2可能通过调控这些基因参与木质素的生物合成。转ClMYB1和ClMYB2基因的烟草植株花期延迟，植株矮化，叶形变大，叶柄更硬挺；转ClMYB1植株多数花而不实，结实量极低，转ClMYB2植株只开花不结实。转ClMYB1、ClMYB2基因烟草茎的切片染色实验中表明，转基因烟草中木质素的含量较之对照有所提高，说明ClMYB1、ClMYB2参与了调控木质素的生物合成。