河北省部分地区PCV2感染情况调查研究

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本研究旨在调查河北省部分地区PCV2的感染情况,研究河北省部分地区猪圆环病毒2型分子的遗传特性及流行趋势,为PCV2疫苗应用和该病的防控提供理论基础。本研究采用荧光定量PCR方法、普通PCR方法对河北省2018~2019年采集的临床样本进行检测,并对部分阳性样本进行全基因组测序。通过对得到的PCV2河北分离株与国内外PCV2参考株的核苷酸序列及推导的氨基酸序列做同源性比对分析,同时构建遗传进化树,了解近几年河北省部分地区猪圆环病毒2型分子的遗传变异情况及其发展趋势;通过对市场上PCV2商品化疫苗的分类汇总,掌握PCV2商品化疫苗的应用现状等。研究内容以及结果如下:1.病料的采集及鉴定:本研究于2018~2019年,在河北省保定、唐山、邢台、邯郸、石家庄、衡水、承德、张家口等地区38个规模猪场共采集临床样本400份。经荧光定量PCR检测,结果显示:保定感染率71%(57/80);唐山感染率89%(78/88);邢台感染率77%(59/77);邯郸感染率65%(30/46);石家庄,感染率73%(33/73);衡水感染率83%(15/18);承德感染率75%(6/8);张家口感染率79%(30/38)。2.全基因组测序及遗传变异分析:通过对部分阳性样本的全基因组序列的测定及运用DNASTAR软件对其拼接比对,证实分离得到的10株PCV2河北分离株全基因组序列长度均为1767bp。运用DNASTAR软件对10株PCV2河北分离株构建系统进化树。结果表明,10株PCV2河北分离株处于2个分支,即PCV2b和PCV2d,其中4株PCV2河北分离株为PCV2b型,6株PCV2河北分离株为PCV2d型。通过DNASTAR软件对得到的10株PCV2河北分离株做核苷酸序列及推导的氨基酸序列同源性对比分析。结果显示:分离得到的10株河北分离株与国内外22株参考株的同源性为94.3%~99.7%,具有较高的同源性。PCV2-ORF1与国内外参考株之间的同源性为96.8%~100%,表明河北分离株PCV2-ORF1相对保守,无明显的地域性。PCV2-ORF2与国内外参考株之间的同源性为78.2%~100%,证明PCV2-ORF2与国内外的参考株有一定的地域性差异。3.对市场上的PCV2商品化疫苗的分类汇总:共收集市场上的PCV2商品化疫苗18种,其中11种基因型为PCV2b型,4种基因型为PCV2a,3种基因型为PCV2d型。调查显示,PCV2商品化疫苗在市场上供应的主要是全病毒灭活疫苗,主要以基因型2b型为主,与目前河北省内PCV2的流行亚型有所差异。
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