科技进步和创新是生产力发展的重要支撑,科技竞争是综合国力竞争的关键,为了推进我国社会主义现代化建设,实现经济的可持续发展,也为了把握住未来发展的机遇,建设创新型国家成为了我国的必然选择。企业是创新活动的主体,中小企业作为企业中占比最大的部分,其创新活动的开展和自身的经营发展会对我国未来的经济发展产生重要影响。目前,中小企业的创新面临着企业内部知识产权管理制度不成熟、创新投入偏低,社会相关保障体系不健全、专利价值评估体系不完善等困境。其中,融资困境占据了非常重要的位置。因此,对中小企业的融资结构、创新投入和经营绩效开展研究具有十分重要的现实意义。本文梳理了融资结构、企业创新投入、企业绩效三者关系,在分析融资结构理论、创新理论及企业经营绩效相关理论的基础上,以378家在中小企业板上市的公司为样本,通过万德数据库、国泰安数据库等渠道收集整理其2011年至2017年间的数据,对样本数据进行处理后借助因子分析法等方法进行了三方面的实证分析:融资结构对企业创新投入的影响、企业创新投入对企业绩效的影响、企业创新投入在融资结构和企业绩效之间的调节作用。研究结果表明,融资结构会影响中小企业的创新投入,但各个融资方式对于创新投入的影响的显著性存在差异。对于我国的中小企业而言,政府补助对创新投入的促进作用最为明显,其次是商业信用融资,然后是内源融资和债券融资。创新投入对当期企业绩效具有显著的抑制作用。在内源融资提升企业绩效的基础上,创新投入能够扩大内源融资对企业绩效的促进作用。同时,创新投入会削弱债务融资对企业绩效的抑制作用。