背景与目的神经侵犯（Perineural Invasion,PNI）与结直肠癌、胰腺癌、胃癌、乳腺癌、前列腺癌、以及头颈部肿瘤等多种恶性肿瘤预后相关,是多种肿瘤预后不良的独立影响因素,而且有关胰腺癌PNI的分子机制研究较为深入和广泛,但目前结直肠癌尤其是Ⅱ期结直肠癌发生PNI的分子机制尚未明确。本研究拟通过比较PNI状态不同的Ⅱ期结直肠癌组织与正常组织的基因组表达差异,初步探索Ⅱ期结直肠癌PNI发生过程中重要的分子事件,为结直肠癌新的肿瘤标记物以及基因靶向治疗位点的筛选提供重要的理论依据。研究方法收集PNI阳性的Ⅱ期结直肠癌组织及配对的正常组织和PNI阴性的Ⅱ期结直肠癌组织及配对的正常组织各5对,运用微阵列比较基因组杂交技术（array Comparative Genomic Hybridization,array-CGH）检测整个基因组染色体拷贝数量的变化,并使用相关软件进行数据分析,确定差异基因组。对array-CGH数据进行GO分析和Pathway分析,从细胞组分、分子功能、生物学过程以及生化代谢途径和信号转导途径等方面研究Ⅱ期结直肠癌组织与配对的正常组织以及不同PNI状态的Ⅱ期结直肠癌组织与正常组织之间的差异基因。扩大样本量,收集不同PNI状态的Ⅱ期结直肠癌组织及配对的正常组织各50对,对相关差异基因进行实时聚合酶链式反应（Real-Time Polymerase Chain Reaction,Real-Time PCR）验证。研究结果与正常组织相比,Ⅱ期结直肠癌组织中共发现13个基因组扩增与18个基因组缺失,其中最为常见的基因组扩增位于7q11.21-q11.22（30%）,8p11.21（30%）,8p12-p11.23（30%）,8q11.1-q11.22（30%）,13q12.13-q12.2（30%）和20q11.21-q11.23（30%）,最为常见的基因组缺失位于17p13.1-p12（60%）,8p23.2（40%）和 18q11.2-q23（40%）。另外发现位于 8p11.23-p11.22,18q21.1,19q11-q12和20q11.21-q13.32的基因组高水平扩增以及位于20p12.1的基因组纯合型缺失。分组分析发现,PNI阳性Ⅱ期结直肠癌组织中,位于7q11.21-q22.1,16p11.2,17q23.3-q25.3,19p13.3-p12 和 20p13-p11.1 的基因组扩增以及位于11q11-q12.1,11p15.5-p15.1,18p11.21 和 18q21.1-q23 的基因组缺失更为常见;而PNI阴性的Ⅱ期结直肠癌组织中,位于8q11.1-q24.3,9q13-q34.3和13q12.3-q13.1的基因组扩增以及位于8p23.3-p12,17p13.3-p11.2和21q22.12的基因组缺失更为常见。与正常组织相比,GO分析发现Ⅱ期结直肠癌组织差异基因主要涉及有机物质生物合成,代谢过程调节,大分子生物合成调控等生物学途径以及DNA结合和有机环化合物结合等分子功能,Pathway分析发现这些基因主要位于信号传导、基因表达、代谢和免疫系统相关通路。另外GO分析发现PNI组的基因改变主要涉及嗅觉受体活动,有机物质生物合成等生物学途径以及DNA结合,嗅觉感受器活动,气味结合和杂环化合物结合等分子功能,非神经侵犯（No Perineural Invasion,NPNI）组的基因改变主要涉及细胞粘附,类黄酮葡萄糖醛酸化等生物学途径以及细胞外配体-门控离子通道活性,肽酶调节活性,肽酶抑制剂活性等分子功能。Pathway分析发现PNI组的基因改变主要位于信号转导,基因表达,代谢等通路,而NPNI组的基因改变主要位于代谢,信号转导,免疫系统,蛋白质代谢等通路。相关差异基因在扩大样本中的Real time PCR验证显示FLT1基因、FBXW7基因和MACROD2基因在PNI阴性Ⅱ期结直肠癌较PNI 阳性Ⅱ期结直肠癌扩增比例高。研究结论相关差异基因的扩增和缺失可能为Ⅱ期结直肠癌发生PNI的早期事件,其可能通过影响细胞的信号转导和基因表达等过程促进神经侵犯的发生发展,嗅觉受体可能在Ⅱ期结直肠癌中PNI的发生中发挥了重要作用。FLT1、FBXW7和MACROD2基因在PNI阴性Ⅱ期结直肠癌扩增更为常见。相关差异基因对于筛选结直肠癌肿瘤标记物以及基因靶向治疗位点具有一定的价值。