裂殖酵母DNA损伤应答基因的全基因组筛选研究

来源 :复旦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:luanwenjie
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因组无时无刻不受到外界化学试剂以及内部生命过程中所带来的DNA损伤的威胁,而这些损伤正是癌症发生、衰老、免疫缺陷以及一些退行性疾病的根源。细胞为了维持基因组的稳定性,在进化中形成了一套应对DNA损伤的机制,包括细胞周期阻滞、DNA损伤修复、凋亡等。其中许多基因参与到这些通路中并发挥着重要的作用,虽然目前已经发现许多参与DNA损伤应答的基因,然而仍然有绝大多数参与DNA损伤应答的新基因有待发现和进一步分析研究。为了进一步完善DNA损伤应答网络,我们以裂殖酵母作为研究对象,利用紫外照射以及5种DNA损伤试剂对3235个裂殖酵母基因缺失突变体进行系统的筛选。最终筛选得到55个参与DNA损伤应答的基因,其中23个未曾有过相关的文献报道。对55个基因进行GO分析发现有19个(占34.5%)基因参与了细胞周期相关的生命过程。流式细胞术分析55个突变体细胞的DNA含量发现其中38个突变体的细胞周期在正常或者DNA损伤条件下发生了阻滞,呈现了四种不同的流式表型,说明这些基因直接或间接的参与了细胞周期的调控过程。为了进一步分析筛选获得的新基因在DNA损伤应答中的功能,我们从四类流式表型中各选出两个突变株(△ash2,△SPAC3F10.17,△SPBC2A9.02,△SPAC27D7.08c△sgf73,△meu29,△sec65,△pab1)进行表达谱芯片分析,这些突变株均对两种以上DNA损伤试剂敏感。结果显示8个突变体芯片数据的聚类分析结果与表型分类相一致,而且8个基因中任意一个的缺失均能引起DNA复制以及细胞分裂相关基因的差异表达。基因回补、形态学鉴定及real time PCR实验结合表达谱芯片结果发现:其中SPBC2A9.02和SPAC27D7.08c通过影响DNA复制起始相关蛋白Abpl以及Abp2的功能来调控DNA复制起始;SGF73、 MEU29、SEC65或者PAB1的缺失会通过影响Sep1-Ace2转录途径来影响细胞分裂后期两个子细胞的正常分离,从而引起突变体细胞二倍体化;同时,SGF73或MEU29的缺失也会降低APB1和APB2的表达,从而影响了DNA复制的起始;另外,SEC65和PAB1也与DNA的重复复制有关,他们的缺失引起了与DNA重复复制有关的CDC18、CDT1以及CDT2等基因的表达上调。这些结果说明这些基因通过参与DNA复制以及细胞周期的调控来参与DNA损伤应答,本研究还发现了许多基因通过参与染色质动态平衡、基因转录调控、DNA损伤修复等机制来参与DNA损伤应答。总之,这些新基因的发现以及鉴定对于进一步揭示和完善DNA损伤应答机制具有重要的意义。碱性甘露聚糖酶是一种半纤维素酶,它能在碱性环境下将甘露聚糖水解成具有重要商业价值的甘露寡糖,因而在食品、医药、饲料、造纸等行业具有重要的应用价值。为了获得高活性、高稳定性的碱性甘露聚糖酶,本研究中我们对枯草芽孢杆菌Bacillus sp. N16-5来源的碱性甘露聚糖酶(MAN493)进行了一定的改造,去除了其C端163个氨基酸,保留其催化结构域,获得了一个截短的碱性甘露聚糖酶(MAN330),并实现了其在鹰嘴豆孢克鲁维酵母(Kluyveromyces cicerisporus)中的高效分泌表达。该重组工程菌株在80世代后仍能稳定地表达碱性甘露聚糖酶。截短的碱性甘露聚糖酶MAN330及其全长蛋白MAN493的酶学属性分析结果表明,MAN330具有与MAN493相同的最适反应pH值、最适反应温度以及底物特异性。然而,在pH值9-11范围内MAN330的pH值稳定性比MAN493的pH值稳定性高7%左右,在60℃C-80℃C范围内MAN330的热稳定性比MAN493的热稳定性高10%左右,可见MAN330比其全长蛋白MAN493具有更广泛的应用价值。因而我们用鹰嘴豆孢克鲁维酵母重组工程菌在摇瓶以及15L发酵罐水平建立了生产碱性甘露聚糖酶MAN330的最适条件,达到的最高产量分别为1378U/ml和3795U/ml。该研究对工业化生产以及应用碱性甘露聚糖酶奠定了一定的基础。
其他文献
针对人工冻结法施工中冻土承受“预静载+动力扰动”这一动静组合受力状态,冻土在静态或准静态荷载作用下的力学特性已取得丰硕的研究成果,但冻土在动静组合加载下的应力-应变
紧紧抓住人物特点促使学生“参与”学习──《小英雄雨来》教学谈江苏卞国华《小英雄雨来》是一篇篇幅较长、富有艺术性的独立阅读课文。根据这一特点,教者可运用“参与式教学
河南省作为中原经济区建设主体,其低碳经济发展的好坏将直接影响到整个中原经济区乃至全国低碳经济发展和低碳竞争力的提升。本文立足河南省省情,基于SWOT模型的视角对河南省
作为一种新型的科学的语言教学法,任务型教学法在我国的实施却遭遇诸多障碍,本文通过分析主客观因素,包括教师、学生、教科书以及操作等方面的影响因素,从而提出了转变传统观念、
<正> 一、前言随着现代化工业生产规模的不断扩大,电化、冶金部门电解槽的直流供电,向大电流,特大容量发展。目前世界上最大的食盐电解槽电流住美国已经达到600KA;西欧与日本
目的 探讨生血胶囊对免疫介导的再生障碍性贫血 (再障 )小鼠骨髓增殖及细胞周期蛋白D3(CyclinD3)表达的影响。方法 建立免疫介导的再障模型。造模当日开始胃饲生血胶囊水提
采用三阶段DEA模型对中国十大城市群综合经济效率进行了测度,分析环境因素的影响作用,提出了优化配置方案。结果显示:中国城市群综合经济效率平均水平较高,但城市群间差异较
滇西澜沧老厂银铅锌多金属矿床是“三江”成矿带南段最具代表性的多金属硫化物矿床之一,其成矿作用主要经历了早石炭世火山喷流沉积成矿与喜山期隐伏花岗斑岩侵位成矿,具有多