近代中医史，有两条络胍，二者各自有限有度地发展，表面上并无连系。此二者乃（甲）中医界对「科学哲学」（或称「科学学」）之重视及（乙）「中医心理学」之提倡。中医界对科学哲学的热诚，正是方兴未艾，然而，中医心理学的研究，似乎已经式微了。 本论文将这两条络胍连接，成为一条崭新的学术管道，从现代的科学哲学去阐释中医於身心诊断与治疗的优势和特点，并且正名之为中医身心医学。 从方法而言，本研究引述之科学系统，超越了老三论（系统论、控制论、信息论）与新三论（耗散结构论、协同论、突变论）的范畴，而以剑桥大学李约瑟之「有机哲学」为经，与瑞士心理巨匠荣格之学说为纬。其实，李、荣二氏之理论体系，都受中国科学（特别是《易经》与道家文化）之影响甚钜。 本论文将中医身心医学分为三个阶段，是为「发源期」（以《黄帝内经》为滥觞）、「高峰期」（以宋明理学为核心）及「现代期」（以朱文锋等人的中医心理学及匡调元的辨质论治为代表），旁徵博引，西为中用，以今证古，用古阐今，带出中医身心医学与西方尖端身心医学之相同处。 本研究之结论如下：从现代的科学哲学观之，中医端的是符合甚至超越了现今身心医学的标准。那么，为何中医仍然处於「前科学」的状态，未被国际学术界承认其科学地位呢？答案是「科学」本身并非永恒不变的真理，而是一个受著社会、经济、政治因素影响之权力系统。纯粹从理论层次观之，中医身心医学无疑是廿一世纪世界医学之典范；然而，从「权力分析」的角度观之，则中医科学地位之建立，必须要看国家是否继续富强，与中央政策是否视之为重心发展的国宝了。