实行项目法人责任制是历史经验的积累，是建设管理体制改革的核心内容，是国家的政策要求。为了适应社会主义市场经济的要求，进一步提高工程建设项目的管理水平，有必要对公益性水利项目如何实行项目法人责任制进行深入探讨。本文通过认真分析我国水利工程实行项目法人责任制的改革进程和国外水利工程建设管理的基本情况，论述了公益性水利项目的经济特征和项目法人责任制的内涵。针对目前我国公益性水利项目实行项目法人责任制的现状，提出了目前水利项目特别是公益性水利工程建设管理中存在责权不对等、筹措资金难、产权主体模糊、配套机制不完善等问题与不足，阐述了公益性水利项目实行项目法人责任制的必要性，文章重点对项目法人责任制的建立、今后公益性水利项目实行项目法人责任制运作模式进行了探讨，提出了今后公益性水利项目建设管理应逐步推行代建制和总承包制、进一步完善项目法人服务体系的观点。本文并就政府在公益性水利项目中的作用、公益性水利项目的投入机制和补偿保值机制以及公益性水利项目实行项目法人责任制的外部环境优化等方面进行了全面论述。