生物信息学是一门生命科学与信息科学交叉而形成的新兴学科。近年来，海量生物实验数据的产生急需发展生物信息技术来分析这些数据，也为计算分析方法提供了充足的数据资源来揭示生命的规律。生物信息学在解决重要的生物学问题、挖掘生物数据中蕴藏的新生物学规律等方面发挥出巨大作用。　　 核小体是真核生物染色质的重要重复单元。大部分的真核基因组DNA是包装在核小体上。参与生理过程的许多调控蛋白需要与核小体竞争来与DNA结合，因而核小体位置在多种生理过程中发挥着重要的作用。随着核小体位置数据的大量累积，为用计算方法理解核小体定位机理提供了可能性。　　 在真核生物里，基因组是普遍转录的，因而存在着大量的非编码RNA。先前的研究表明反义转录会影响基因转录。研究翻译转录和核小体定位之间的关系。发现反义转录与基因启动子上核小体占位率相关。而且，反义转录本提高它覆盖区域的核小体占位率，降低它末端附近的核小体占位率。这些结果揭示了翻译转录对核小体定位的影响。　　 固有的DNA序列是核小体定位的一个重要决定因素。部分核小体定位由不同DNA序列相对应的不同弯曲和扭曲属性所决定。研究序列替换是否受到核小体结构维持的选择性约束。发现核小体DNA和缺失核小体的DNA之间存在着不同的序列替换模式:有利于核小体形成的序列替换在核小体DNA上普遍，而阻碍核小体形成的序列替换在缺失核小体的DNA上普遍。序列替换受到核小体定位强烈选择的基因具有稳定的核小体定位和低的表达可变性。