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现代高密度工厂化水产养殖业，水体中氨和亚硝酸盐浓度过高，是养殖水域中诱发暴发性疾病甚至死亡的重要因素之一。本论文针对水产养殖水体经常出现氨氮、亚硝态氮浓度过高的问题，筛选到高效氨氮降解菌X2及高效反硝化细菌A1，将两株菌运用于养殖水体，实验结果表明两株菌对水体中的氨氮、亚硝态氮、CODMn(chemicaloxygendemand)有很好的去除效果。
为减少水体的氨氮污染，从实验室保藏菌种中分离筛选到高效氨氮降解菌X2，经16SrDNA鉴定为解淀粉芽孢杆菌，该菌株的生长与氨氮降解是同步进行的；其降解氨氮的最适温度为30℃，最适pH值为7.0，氨氮初始浓度为50mg/L，在24h内氨氮降解率达95.40％。当氨氮初始浓度≤50mg/L时，氨氮降解率均可达95％以上；该菌株可以多种糖为唯一碳源生长，并均具有较高的氨氮降解率。
为减少水体的亚硝态氮污染，通过BTB平板初筛及反硝化培养基复筛，从养殖水体中分离筛选到一株高效的兼性反硝化细菌A1，经16SrDNA鉴定为枯草芽孢杆菌，该菌的反硝化作用主要发生在菌体的对数生长期。在厌氧条件下，枯草芽孢杆菌对亚硝态氮的去除率达到96.82％；在有氧条件下，溶解氧为5mg/L时，亚硝态氮去除率达到99.01％。该菌株在反硝化最适温度为28℃，最适pH为7.0时，亚硝态氮的去除率达到98.57％。当亚硝态氮初始浓度为1.02mg/L时，亚硝态氮去除率最高，达到98.55％，但随着亚硝态氮初始浓度的升高，该菌株对亚硝态氮的去除率明显下降。以葡萄糖作为唯一碳源，该菌株的反硝化活性最高，亚硝态氮的去除率达到99.32％。
在氨氮初始浓度为4.13mg/L养殖水体中，30℃，120r/min，培养48h后解淀粉芽孢杆菌对氨氮降解率为94.92％，对水体CODMn下降了84.22％。在外加碳源葡萄糖的养殖水体中，亚硝态氮初始浓度为1.09mg/L，28℃，100r/min，培养48h后，枯草芽孢杆菌对亚硝态氮的去除率达99.08％，而不外加碳源的水体中亚硝态氮未被降解反而升高，说明反硝化菌在有可被利用的碳源存在时，才能充分发挥作用。当碳氮摩尔比达到8:1时，48h后枯草芽孢杆菌对水体中亚硝态氮去除率达99.05％，对水体中CODMn下降率达88.60％。
在10L外加碳源葡萄糖的养殖水体中，20～25℃，两菌混合最佳比例为1:2时，氨氮降解率为73.53％，亚硝态氮去除率为80.38％，CODMn下降率为62.87％，对三者的去除效果都较好。饲料代替葡萄糖加入水体中亚硝态氮去除率14.50％，去除率降低了65.88％，说明饲料中没有足够的可被利用的碳源。