头束霉属(Cephalotrichum)和帚霉属(Scopulariopsis)均属粪壳菌纲(Sordariomycetes),小囊菌目(Microascales),小囊菌科(Microascaceae)。两属真菌,多营腐生或弱寄生生活,分布广泛,普遍生存于土壤,也常分离自空气、植物残体、动物粪便、纺织品、乳酪和潮湿的室内环境中。两属部分种为室内真菌,尤其帚霉属一些种类能导致人类机会性感染,威胁人类健康;一些种是植物病原菌,可侵染多种植物;另一方面,两属真菌一些种可以产生多种有益的次级代谢产物,可应用于医疗、工业及农业等领域。因此,对两属真菌的准确鉴定是对其深入研究和开发利用的基础。至2017年,Index Fungorum共记录Cephalotrichum 81种、Scopulariopsis 112种。虽然两属记录的种很多,但由于部分模式标本的缺失,加上传统形态学鉴定方法的不足,两属很多种的分类地位存在争议和处于不断变更中。本论文采集分离及收集两属菌株,在形态学研究的基础上,结合多基因系统学探讨两属的分类学问题。自2017年至2019年,从贵州省的贵阳、罗甸、遵义等多地采集600余份土壤,经平板稀释法分离获得400多份菌株,经鉴定,Cephalotrichum属11株,另外,山东农业大学赠送了Cephalotrichum 44株和Scopulariopsis 13株。这样,共获得Cephalotrichum 55株,Scopulariopsis 13株菌株。在形态学基础上,联合ITS,LSU,TUB2和TEF1基因片段构建单基因和多基因系统发育树,共鉴定出Cephalotrichum-like新种4个,分别为C.catenulatum,C.humicola,C.tongrenense和C.septum;中国新纪录种1个,为C.domesticum;已报道种7个,分别为C.asperulum,C.gorgonifer,C.microsporum,C.nanum,C.stemonitis,C.verrucisporum,C.purpureofuscum。于Scopulariopsis及其有性态属Microascus,鉴定出2个新种,分别为M.ellipsoideum,M.globose;1个新组合种,为M.verrucifera;1个中国新纪录种,为M.verrucosus;2个已报道种,分别为S.asperula,M.croci。利用最大似然(ML)、最大简约(MP)和贝叶斯推理(BI)三种算法,分析四个基因片段(ITS,LSU,TUB2和TEF1)对Cephalotrichum、Scopulariopsi及其近似属的区分度,并结合扩增率和支持率,筛选出适合两属真菌分类的最优基因片段。