2003年建立的企业国有资产监督管理新体制,导致多户国有企业隶属于同一个履行出资人职责的机构,在法理上,属于同一个出资人的所有企业之间存在关联关系,互为关联企业。这种结果当然是立法者不愿看到的,为此,2013年修订的《公司法》规定“国家控股的企业之间不仅因为同受国家控股而具有关联关系。”还有2008年出台的《企业国有资产法》,其规定国家出资企业的关联方没有控股股东。但这些规定只是掩耳盗铃而已,不能否认他们之间关联关系的事实存在,并可能产生违背市场经济规律,增加国际贸易往来风险,甚至引发不必要的国家诉讼等问题。通过对关联关系、关联企业和关联交易三个方面探讨国有企业关联制度问题,通过国内外相关理论、制度、实践的对比,国有企业的这种关联关系的消解并不困难：根据国有企业不同性质设立多个不同的国有资本运营机构,让其来行使出资人职责,将国资委和各国有资产监督管理机构的出资人职责剥离,成为干净的监督者,二者各行其职,更有利于国有企业的发展,有利于健全我国市场经济体制,发挥市场的决定性作用。